More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1897 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  77.54 
 
 		 425 aa  682    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  79.2 
 
 		 425 aa  695    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  76.25 
 
 		 422 aa  665    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  97.88 
 
 		 425 aa  843    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 424 aa  857    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  73.52 
 
 		 425 aa  639    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  71.16 
 
 		 424 aa  635    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  60.52 
 
 		 425 aa  546  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  59 
 
 		 426 aa  510  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.6 
 
 		 428 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.37 
 
 		 429 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.16 
 
 		 429 aa  458  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.9 
 
 		 433 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.66 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.43 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.36 
 
 		 436 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  53.43 
 
 		 433 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.01 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  50.71 
 
 		 431 aa  435  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.76 
 
 		 439 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  52.37 
 
 		 428 aa  433  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.8 
 
 		 442 aa  431  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  50 
 
 		 431 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  52.36 
 
 		 431 aa  424  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.17 
 
 		 434 aa  418  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  55.63 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.29 
 
 		 429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  46.71 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  46.71 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  48.59 
 
 		 428 aa  401  1e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  48.94 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.92 
 
 		 441 aa  395  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.18 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.79 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.57 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  47.42 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  46.95 
 
 		 425 aa  385  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  46.08 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  50 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  46.46 
 
 		 426 aa  383  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  46.87 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.91 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.07 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.71 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.24 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.71 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.42 
 
 		 425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.34 
 
 		 426 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.22 
 
 		 438 aa  352  5.9999999999999994e-96  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.88 
 
 		 448 aa  351  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.26 
 
 		 435 aa  351  2e-95  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  45.28 
 
 		 447 aa  350  3e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.91 
 
 		 497 aa  350  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.57 
 
 		 473 aa  349  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.34 
 
 		 447 aa  348  8e-95  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  44.24 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  43.63 
 
 		 427 aa  346  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  44.26 
 
 		 459 aa  344  1e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.14 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  45.66 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  43.78 
 
 		 432 aa  342  8e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  41.98 
 
 		 433 aa  342  9e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  42.22 
 
 		 428 aa  341  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  42.22 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  42.22 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  42.22 
 
 		 428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.28 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  40.05 
 
 		 429 aa  338  9e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  42.59 
 
 		 423 aa  338  9e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  41.98 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  41.98 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  41.98 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  43.12 
 
 		 431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  43.43 
 
 		 431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  43.43 
 
 		 431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  41.98 
 
 		 428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  45.07 
 
 		 428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  41.51 
 
 		 428 aa  335  9e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.53 
 
 		 429 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3185  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.37 
 
 		 419 aa  333  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  41.75 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  41.75 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  42.6 
 
 		 440 aa  333  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1870  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.25 
 
 		 420 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  41.51 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  41.51 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3119  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.24 
 
 		 419 aa  332  6e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317311  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  45.43 
 
 		 425 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  40.8 
 
 		 433 aa  332  8e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.13 
 
 		 437 aa  332  9e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.21 
 
 		 433 aa  331  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  41.75 
 
 		 433 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2965  dihydroorotase  45.57 
 
 		 426 aa  330  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.322465  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  43.36 
 
 		 431 aa  329  7e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  43.47 
 
 		 448 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  44.01 
 
 		 432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  42.01 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0816  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.81 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  41.27 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  45.05 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>