More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3029 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  90.3 
 
 		 436 aa  782    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  82.64 
 
 		 433 aa  716    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  83.14 
 
 		 433 aa  731    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  94.46 
 
 		 436 aa  809    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  87.07 
 
 		 437 aa  739    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  100 
 
 		 433 aa  864    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  83.6 
 
 		 433 aa  726    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  66.51 
 
 		 438 aa  578  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  62.17 
 
 		 433 aa  518  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  62.41 
 
 		 434 aa  521  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  61.88 
 
 		 433 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  61.47 
 
 		 434 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  61.1 
 
 		 430 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  60.75 
 
 		 439 aa  495  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  60.66 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  58.16 
 
 		 428 aa  488  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  59.1 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  57.92 
 
 		 428 aa  484  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  57.96 
 
 		 433 aa  481  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  58.59 
 
 		 446 aa  481  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  54.82 
 
 		 431 aa  478  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  56.13 
 
 		 429 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  57.14 
 
 		 434 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  55.21 
 
 		 428 aa  459  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  53.29 
 
 		 430 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  53.29 
 
 		 430 aa  435  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  50.12 
 
 		 432 aa  411  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.53 
 
 		 434 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.02 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.35 
 
 		 425 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  50.35 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.65 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  50.12 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  48.72 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  50.82 
 
 		 432 aa  378  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.1 
 
 		 430 aa  359  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  44.81 
 
 		 428 aa  359  5e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  41 
 
 		 447 aa  352  7e-96  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  39.19 
 
 		 447 aa  346  5e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.98 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.75 
 
 		 424 aa  342  7e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.57 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  41.04 
 
 		 422 aa  333  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.08 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.51 
 
 		 434 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  38.35 
 
 		 459 aa  328  9e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  42.08 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.59 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.43 
 
 		 425 aa  326  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.65 
 
 		 428 aa  325  7e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.37 
 
 		 434 aa  323  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  41.08 
 
 		 436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  43.9 
 
 		 431 aa  319  7e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.01 
 
 		 428 aa  317  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.59 
 
 		 425 aa  316  4e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  40.61 
 
 		 427 aa  312  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  37.12 
 
 		 426 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.3 
 
 		 428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  40.14 
 
 		 431 aa  310  4e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.69 
 
 		 429 aa  309  5.9999999999999995e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.43 
 
 		 429 aa  305  7e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.47 
 
 		 429 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  40.38 
 
 		 431 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.26 
 
 		 431 aa  305  9.000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  39.95 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.62 
 
 		 438 aa  303  5.000000000000001e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.28 
 
 		 433 aa  299  8e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  38.12 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  38.35 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.52 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.38 
 
 		 433 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  38.12 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.53 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  39.91 
 
 		 433 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.14 
 
 		 433 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  40.14 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  39.29 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  37.88 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.16 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.68 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1714  dihydroorotase  40.38 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.644473  normal  0.407815 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  37.86 
 
 		 429 aa  288  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.24 
 
 		 426 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  33.72 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.44 
 
 		 430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  39.44 
 
 		 439 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.76 
 
 		 425 aa  282  6.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.2 
 
 		 430 aa  282  8.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  37.89 
 
 		 426 aa  282  1e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.53 
 
 		 430 aa  280  3e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  38.75 
 
 		 431 aa  280  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  40.57 
 
 		 448 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.24 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  38.92 
 
 		 425 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  36.38 
 
 		 424 aa  278  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.55 
 
 		 497 aa  277  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.98 
 
 		 497 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  36.77 
 
 		 425 aa  277  3e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  37.88 
 
 		 425 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  37.88 
 
 		 425 aa  276  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>