More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2835 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 433 aa  871    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  58.67 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  60.09 
 
 		 434 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  58.19 
 
 		 436 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  60.09 
 
 		 434 aa  481  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  57.96 
 
 		 433 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  57.72 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  62.29 
 
 		 433 aa  481  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  57.01 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  57.28 
 
 		 428 aa  478  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  57.48 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  57.51 
 
 		 428 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  59.62 
 
 		 434 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  56.81 
 
 		 428 aa  473  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  59.86 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  58.19 
 
 		 437 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  57.18 
 
 		 438 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  60.72 
 
 		 430 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  53.66 
 
 		 432 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  50.59 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  52.74 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  52.82 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.32 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  52.97 
 
 		 430 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.72 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  53.25 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  51.67 
 
 		 430 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  44.58 
 
 		 447 aa  376  1e-103  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.81 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.29 
 
 		 434 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.4 
 
 		 447 aa  375  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  48.6 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.71 
 
 		 423 aa  363  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.95 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  47.42 
 
 		 422 aa  353  2.9999999999999997e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  46.95 
 
 		 425 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.69 
 
 		 428 aa  352  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  43.53 
 
 		 459 aa  350  2e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.45 
 
 		 424 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.66 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  48.35 
 
 		 432 aa  342  9e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.62 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.63 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.45 
 
 		 424 aa  329  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.93 
 
 		 425 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  42.25 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.73 
 
 		 425 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0923  amidohydrolase  44.5 
 
 		 407 aa  317  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.671663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  42.48 
 
 		 425 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.82 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  41.87 
 
 		 425 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  41.87 
 
 		 425 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  41.87 
 
 		 425 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  41.87 
 
 		 425 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  41.87 
 
 		 425 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  41.87 
 
 		 425 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  41.87 
 
 		 425 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.67 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  41.39 
 
 		 425 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  40.77 
 
 		 422 aa  306  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  39.81 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.86 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1714  dihydroorotase  41.98 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.644473  normal  0.407815 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  39.34 
 
 		 436 aa  302  6.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  40.57 
 
 		 425 aa  302  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.71 
 
 		 441 aa  301  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  40.57 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0603  dihydroorotase  45.45 
 
 		 409 aa  299  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  38.04 
 
 		 426 aa  299  7e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.95 
 
 		 429 aa  298  9e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.76 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  40.86 
 
 		 425 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  40.91 
 
 		 425 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.5 
 
 		 429 aa  296  5e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  40.62 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  42.11 
 
 		 433 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.31 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.11 
 
 		 433 aa  294  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.03 
 
 		 428 aa  293  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  39.39 
 
 		 431 aa  292  8e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.24 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  40.05 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  39.23 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  40.52 
 
 		 431 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.75 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  38.17 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  40.23 
 
 		 431 aa  290  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  40.23 
 
 		 431 aa  290  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.12 
 
 		 434 aa  289  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  40.71 
 
 		 429 aa  289  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  39.57 
 
 		 428 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  41.15 
 
 		 425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  41.15 
 
 		 425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  38.63 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  40.91 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  40.91 
 
 		 425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  39.57 
 
 		 428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  38.76 
 
 		 439 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  39.19 
 
 		 428 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  39.51 
 
 		 427 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>