More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0472 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
434 aa  851    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  84.33 
 
 
434 aa  711    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  82.34 
 
 
430 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  82.42 
 
 
433 aa  680    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  85.02 
 
 
434 aa  717    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  84.95 
 
 
433 aa  714    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  65.8 
 
 
433 aa  536  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  64.37 
 
 
433 aa  521  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  63.74 
 
 
436 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  61.76 
 
 
433 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  62.17 
 
 
446 aa  504  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  61.37 
 
 
436 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  62.8 
 
 
437 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  61.37 
 
 
433 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  61.85 
 
 
438 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  60 
 
 
439 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  60.33 
 
 
433 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  59.67 
 
 
428 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  56.81 
 
 
429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  57.34 
 
 
428 aa  463  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  57.58 
 
 
428 aa  463  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  56.1 
 
 
428 aa  449  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  56.64 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  56.81 
 
 
430 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  51.29 
 
 
431 aa  439  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  55.5 
 
 
430 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  52.76 
 
 
432 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.48 
 
 
423 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  51.18 
 
 
422 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  49.77 
 
 
436 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.82 
 
 
425 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.88 
 
 
434 aa  385  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  48.58 
 
 
425 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.12 
 
 
424 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  51.06 
 
 
432 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.66 
 
 
430 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.51 
 
 
428 aa  350  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  44.44 
 
 
428 aa  350  3e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.02 
 
 
425 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  39.9 
 
 
422 aa  332  8e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.13 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  40.94 
 
 
425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.9 
 
 
424 aa  327  3e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.14 
 
 
425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.52 
 
 
429 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  43.57 
 
 
425 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  40.57 
 
 
436 aa  323  5e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.57 
 
 
425 aa  322  6e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  44.02 
 
 
425 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  44.02 
 
 
425 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  44.02 
 
 
425 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  44.02 
 
 
425 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  44.02 
 
 
425 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  44.02 
 
 
425 aa  322  7e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  43.57 
 
 
425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  43.33 
 
 
425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  43.78 
 
 
425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  44.02 
 
 
425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  39.29 
 
 
431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  38.63 
 
 
447 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  44.87 
 
 
428 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  40.8 
 
 
427 aa  317  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.32 
 
 
429 aa  317  3e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.91 
 
 
434 aa  315  8e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  39.43 
 
 
459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  44.26 
 
 
425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  38 
 
 
447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.21 
 
 
425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  43.68 
 
 
428 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.52 
 
 
427 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  40.91 
 
 
425 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  42.52 
 
 
446 aa  310  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.39 
 
 
442 aa  310  4e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.08 
 
 
433 aa  310  5e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  42.22 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.34 
 
 
434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.67 
 
 
429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  41.57 
 
 
431 aa  306  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  44.5 
 
 
425 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  44.5 
 
 
425 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  43.19 
 
 
431 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  41.08 
 
 
431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  41.08 
 
 
431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  37.29 
 
 
426 aa  306  6e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  44.26 
 
 
425 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  44.26 
 
 
425 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.81 
 
 
438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.04 
 
 
428 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.49 
 
 
433 aa  302  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.88 
 
 
429 aa  301  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  37.86 
 
 
429 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.46 
 
 
425 aa  300  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.53 
 
 
439 aa  301  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.99 
 
 
441 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  42.06 
 
 
427 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.76 
 
 
436 aa  299  7e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.32 
 
 
433 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  37.06 
 
 
426 aa  298  1e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  40.91 
 
 
424 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  39.15 
 
 
428 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>