More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3905 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  100 
 
 
422 aa  850    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  73.81 
 
 
425 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  73.81 
 
 
425 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  72.73 
 
 
424 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  69.23 
 
 
436 aa  568  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  70.91 
 
 
423 aa  560  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  73.1 
 
 
432 aa  556  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.42 
 
 
434 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.9 
 
 
433 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.18 
 
 
434 aa  398  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  51.06 
 
 
436 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  51.54 
 
 
433 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.07 
 
 
433 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  50.59 
 
 
436 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  50.12 
 
 
433 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.35 
 
 
434 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.94 
 
 
434 aa  387  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  49.65 
 
 
433 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.76 
 
 
430 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  50.7 
 
 
433 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  50.83 
 
 
437 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  48.7 
 
 
438 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.53 
 
 
439 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  48.13 
 
 
428 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  45.15 
 
 
431 aa  361  2e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  48.36 
 
 
428 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.42 
 
 
433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  46.5 
 
 
428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  46.24 
 
 
429 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  46.26 
 
 
428 aa  354  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.7 
 
 
446 aa  350  3e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  47.17 
 
 
434 aa  349  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  45.58 
 
 
432 aa  349  5e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  47.76 
 
 
430 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  48.82 
 
 
430 aa  339  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.25 
 
 
430 aa  298  1e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  38.28 
 
 
459 aa  292  7e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.86 
 
 
438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  37.44 
 
 
427 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  34.43 
 
 
447 aa  279  7e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.67 
 
 
428 aa  278  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0603  dihydroorotase  43.2 
 
 
409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  36.26 
 
 
436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  38.24 
 
 
428 aa  273  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  36.9 
 
 
425 aa  272  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  36.75 
 
 
425 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.34 
 
 
436 aa  271  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.57 
 
 
447 aa  271  2e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  37.41 
 
 
428 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.3 
 
 
425 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  36.04 
 
 
425 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.9 
 
 
428 aa  264  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.83 
 
 
424 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.56 
 
 
425 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  37.56 
 
 
423 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  37.23 
 
 
423 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  37.44 
 
 
425 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  37.44 
 
 
425 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  37.44 
 
 
425 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  37.44 
 
 
425 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  36.99 
 
 
425 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  35.8 
 
 
425 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  37.44 
 
 
425 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.87 
 
 
426 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  37.44 
 
 
425 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  37.44 
 
 
425 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  37.14 
 
 
424 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  37.29 
 
 
431 aa  259  8e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  37.74 
 
 
423 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  35.61 
 
 
422 aa  258  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.22 
 
 
423 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  34.68 
 
 
429 aa  257  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.63 
 
 
424 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0923  amidohydrolase  41.49 
 
 
407 aa  256  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.671663  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  36.71 
 
 
425 aa  256  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  36.47 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  36.99 
 
 
439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  36.47 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  38.23 
 
 
431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  32.54 
 
 
426 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.98 
 
 
429 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.65 
 
 
425 aa  253  6e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.89 
 
 
425 aa  253  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.3 
 
 
427 aa  252  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  37.3 
 
 
446 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.71 
 
 
441 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.2 
 
 
425 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.87 
 
 
434 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.49 
 
 
429 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  33.81 
 
 
431 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1714  dihydroorotase  35.93 
 
 
425 aa  251  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.644473  normal  0.407815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  37.8 
 
 
448 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  36.02 
 
 
424 aa  249  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.73 
 
 
428 aa  249  7e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.55 
 
 
433 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  36.99 
 
 
423 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  36.94 
 
 
423 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.02 
 
 
434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  35 
 
 
426 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  34.28 
 
 
424 aa  246  6e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>