More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1642 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 430 aa  843    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  66.43 
 
 		 428 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  54.29 
 
 		 432 aa  418  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.81 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.47 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.92 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.35 
 
 		 433 aa  364  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.66 
 
 		 434 aa  362  6e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.66 
 
 		 434 aa  360  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  47.54 
 
 		 436 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  48.1 
 
 		 433 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  48.23 
 
 		 433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  45.99 
 
 		 433 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  47.63 
 
 		 433 aa  355  8.999999999999999e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  47.39 
 
 		 436 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.66 
 
 		 434 aa  352  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.37 
 
 		 424 aa  350  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  47.39 
 
 		 437 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  45.9 
 
 		 428 aa  345  8.999999999999999e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  47.52 
 
 		 438 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  44.26 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  42.45 
 
 		 431 aa  342  7e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  44.84 
 
 		 428 aa  342  8e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  43.71 
 
 		 429 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  44.26 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.51 
 
 		 425 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.33 
 
 		 424 aa  333  5e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.5 
 
 		 425 aa  332  6e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.97 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.09 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.85 
 
 		 436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  44.84 
 
 		 428 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  44.05 
 
 		 434 aa  325  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.71 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  41.33 
 
 		 422 aa  323  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  42.55 
 
 		 425 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  40.38 
 
 		 436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  40.14 
 
 		 427 aa  316  5e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  43.74 
 
 		 430 aa  315  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  44.81 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.41 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.23 
 
 		 439 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.35 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.26 
 
 		 447 aa  310  2e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.63 
 
 		 423 aa  305  7e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  41.43 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.42 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  38.76 
 
 		 426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  38.97 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  40.81 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  42.42 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  40.81 
 
 		 425 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  41.11 
 
 		 425 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.22 
 
 		 439 aa  302  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  35.85 
 
 		 447 aa  298  9e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  37 
 
 		 459 aa  298  2e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  40.96 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  40.96 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  40.96 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  40.96 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  40.96 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  40.96 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  42.22 
 
 		 431 aa  297  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  42.11 
 
 		 428 aa  296  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  40.96 
 
 		 425 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  40.72 
 
 		 425 aa  295  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  40.71 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  42.25 
 
 		 422 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.81 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.51 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  42.04 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  41.69 
 
 		 425 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  39.67 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.05 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  39.72 
 
 		 439 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  38.97 
 
 		 429 aa  292  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.63 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  40.55 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.68 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  42.15 
 
 		 427 aa  289  8e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  38.61 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  39.9 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.09 
 
 		 424 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0898  dihydroorotase  40.05 
 
 		 442 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.15 
 
 		 429 aa  286  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.19 
 
 		 430 aa  286  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.63 
 
 		 438 aa  286  4e-76  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.05 
 
 		 430 aa  286  5e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  39.35 
 
 		 435 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.05 
 
 		 488 aa  286  5e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  40.14 
 
 		 428 aa  286  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.28 
 
 		 430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.29 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  42.76 
 
 		 432 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  39.23 
 
 		 426 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.5 
 
 		 428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.55 
 
 		 434 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0923  amidohydrolase  45.07 
 
 		 407 aa  283  5.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.671663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.43 
 
 		 429 aa  281  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  40.72 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>