More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3311 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  93.54 
 
 		 430 aa  738    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  82.42 
 
 		 434 aa  654    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 433 aa  856    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  86.05 
 
 		 434 aa  708    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  85.82 
 
 		 434 aa  705    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  84.16 
 
 		 433 aa  691    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  64.24 
 
 		 433 aa  528  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  64 
 
 		 436 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  61.65 
 
 		 433 aa  519  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  61.88 
 
 		 433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  62.82 
 
 		 433 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  61.41 
 
 		 436 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  62.59 
 
 		 437 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  61.56 
 
 		 446 aa  501  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  61.27 
 
 		 438 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  62.29 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  58.88 
 
 		 439 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  56.57 
 
 		 429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  60.28 
 
 		 428 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  58.87 
 
 		 428 aa  465  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  58.63 
 
 		 428 aa  464  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  53.7 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  56.94 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  58.18 
 
 		 430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  57.21 
 
 		 428 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  56.34 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  54.78 
 
 		 432 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.08 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  51.07 
 
 		 422 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  50.24 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  52.13 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  49.53 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.53 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.65 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.35 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.47 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  45.09 
 
 		 428 aa  355  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.37 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  43.19 
 
 		 427 aa  342  5.999999999999999e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  44.79 
 
 		 425 aa  335  9e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  42.02 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  44.08 
 
 		 425 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  44.29 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  44.29 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  44.29 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  44.29 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  44.29 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  44.29 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  39.95 
 
 		 422 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.94 
 
 		 425 aa  329  6e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  40.28 
 
 		 447 aa  329  7e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  44.29 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  43.84 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  43.81 
 
 		 425 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  43.12 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  43.12 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  44.14 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.9 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  41.27 
 
 		 425 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.82 
 
 		 447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  44.06 
 
 		 431 aa  319  7e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  44.42 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.71 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  42.86 
 
 		 439 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.19 
 
 		 425 aa  316  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.95 
 
 		 424 aa  316  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  43.81 
 
 		 425 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  42.14 
 
 		 425 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  42.42 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  42.42 
 
 		 424 aa  312  5.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.1 
 
 		 425 aa  312  9e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  44.29 
 
 		 448 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.95 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.73 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  43.79 
 
 		 427 aa  308  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.41 
 
 		 434 aa  309  8e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.15 
 
 		 425 aa  308  9e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  41.26 
 
 		 435 aa  308  9e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  39.48 
 
 		 459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.88 
 
 		 429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  42.76 
 
 		 428 aa  306  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  40.85 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.95 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  40.14 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.09 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  38.21 
 
 		 431 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  43.57 
 
 		 425 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  43.57 
 
 		 425 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  43.57 
 
 		 425 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.19 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  38.24 
 
 		 429 aa  300  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  40.79 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  39.77 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  42.86 
 
 		 425 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.95 
 
 		 428 aa  298  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0603  dihydroorotase  45.93 
 
 		 409 aa  297  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.01 
 
 		 425 aa  296  5e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.34 
 
 		 442 aa  296  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  40.38 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  35.61 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>