More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0603 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0603  dihydroorotase  100 
 
 		 409 aa  794    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0923  amidohydrolase  65.19 
 
 		 407 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.671663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3062  dihydroorotase  63.18 
 
 		 409 aa  466  9.999999999999999e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.95 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.69 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.11 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.87 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.18 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  41.61 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.65 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.17 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.45 
 
 		 430 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  43.17 
 
 		 425 aa  299  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  45.56 
 
 		 432 aa  298  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  43.33 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.6 
 
 		 430 aa  298  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  42.89 
 
 		 432 aa  296  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.31 
 
 		 434 aa  296  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  41.81 
 
 		 428 aa  295  9e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.22 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.41 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  41.57 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  41.67 
 
 		 428 aa  292  8e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  43.54 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.51 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  43.2 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.52 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  42.38 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  41 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  41.19 
 
 		 436 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  41 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  41.35 
 
 		 425 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  39.1 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  41 
 
 		 437 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.46 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  39.81 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  38.74 
 
 		 422 aa  272  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  39.76 
 
 		 436 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  40.65 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  39.44 
 
 		 434 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.77 
 
 		 424 aa  266  5e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.24 
 
 		 425 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.94 
 
 		 425 aa  266  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  38.17 
 
 		 429 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.82 
 
 		 425 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.57 
 
 		 434 aa  260  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.15 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  40.15 
 
 		 425 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  40.15 
 
 		 425 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  40.15 
 
 		 425 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.23 
 
 		 428 aa  259  8e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  40.15 
 
 		 425 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  40.15 
 
 		 425 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  40.15 
 
 		 425 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  38.81 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  39.15 
 
 		 430 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  40.15 
 
 		 425 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  39.9 
 
 		 425 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  35.34 
 
 		 426 aa  257  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  37.41 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.21 
 
 		 429 aa  256  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  38.81 
 
 		 425 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  37.35 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.06 
 
 		 428 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.38 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  38.1 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  38.44 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.8 
 
 		 442 aa  253  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  40.34 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1714  dihydroorotase  39.62 
 
 		 425 aa  253  3e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.644473  normal  0.407815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.86 
 
 		 429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  38.72 
 
 		 423 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.74 
 
 		 427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.15 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  40.29 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.68 
 
 		 441 aa  250  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  35.56 
 
 		 427 aa  249  6e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.5 
 
 		 429 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  38.05 
 
 		 429 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  35.32 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.74 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.71 
 
 		 433 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.93 
 
 		 438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  38.35 
 
 		 433 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.12 
 
 		 433 aa  245  9e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  38.44 
 
 		 426 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  38.59 
 
 		 428 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  38.28 
 
 		 423 aa  243  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.88 
 
 		 433 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  38.95 
 
 		 423 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.43 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  37.62 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  39.85 
 
 		 425 aa  239  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  37.86 
 
 		 423 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  37.25 
 
 		 415 aa  239  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  37.86 
 
 		 423 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  35.87 
 
 		 425 aa  239  8e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  39.61 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  39.61 
 
 		 425 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.43 
 
 		 426 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>