More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3513 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
433 aa  856    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  93.97 
 
 
434 aa  786    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  95.13 
 
 
434 aa  797    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  84.16 
 
 
433 aa  691    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  84.76 
 
 
430 aa  674    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  84.95 
 
 
434 aa  685    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  64.69 
 
 
433 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  62.56 
 
 
433 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  63.12 
 
 
436 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  63.27 
 
 
433 aa  523  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  62.17 
 
 
436 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  63.59 
 
 
437 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  62.17 
 
 
433 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  60.99 
 
 
438 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  59.81 
 
 
446 aa  482  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  59.86 
 
 
439 aa  482  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  57.31 
 
 
429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  59.86 
 
 
433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  58.82 
 
 
428 aa  461  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  56.47 
 
 
428 aa  451  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  56.44 
 
 
434 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  56.71 
 
 
428 aa  451  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  53.9 
 
 
431 aa  444  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  55.92 
 
 
428 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  56.6 
 
 
430 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  55.16 
 
 
432 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  56.5 
 
 
430 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.35 
 
 
434 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  51.9 
 
 
422 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  50.8 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.99 
 
 
423 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  50.12 
 
 
425 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.76 
 
 
425 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.41 
 
 
424 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  51.76 
 
 
432 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.35 
 
 
430 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  45.05 
 
 
428 aa  349  4e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.28 
 
 
428 aa  349  5e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.62 
 
 
425 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.02 
 
 
425 aa  335  9e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  40.9 
 
 
422 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.12 
 
 
424 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.55 
 
 
424 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  41.82 
 
 
427 aa  330  4e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.9 
 
 
425 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  44.31 
 
 
425 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  44.31 
 
 
425 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  44.31 
 
 
425 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  44.31 
 
 
425 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  44.31 
 
 
425 aa  323  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  44.31 
 
 
425 aa  323  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.19 
 
 
429 aa  322  6e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.24 
 
 
434 aa  322  8e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  40.24 
 
 
425 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  44.08 
 
 
425 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.57 
 
 
425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  42.69 
 
 
425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  43.16 
 
 
425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  43.84 
 
 
425 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  40.42 
 
 
436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  42.45 
 
 
425 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  44.68 
 
 
428 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  44.31 
 
 
425 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  39.77 
 
 
431 aa  316  6e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  39.24 
 
 
447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  41.47 
 
 
425 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.34 
 
 
441 aa  313  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.64 
 
 
447 aa  313  4.999999999999999e-84  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  39.9 
 
 
459 aa  312  5.999999999999999e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  45.02 
 
 
425 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  44.55 
 
 
425 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  44.55 
 
 
425 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.81 
 
 
434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.69 
 
 
429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.22 
 
 
433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  43.26 
 
 
428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  38.68 
 
 
426 aa  306  6e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  41.27 
 
 
424 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  39.01 
 
 
429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  44.08 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  40.79 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  40.79 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.55 
 
 
428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.23 
 
 
438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  41.72 
 
 
427 aa  302  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  39.39 
 
 
428 aa  301  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  40.57 
 
 
431 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.7 
 
 
442 aa  300  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  40.33 
 
 
439 aa  299  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  41.13 
 
 
426 aa  299  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  40.65 
 
 
446 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.66 
 
 
429 aa  297  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.94 
 
 
428 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0923  amidohydrolase  42.48 
 
 
407 aa  298  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.671663  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  38.12 
 
 
426 aa  297  2e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  40.75 
 
 
431 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  41.98 
 
 
448 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.45 
 
 
433 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  41.49 
 
 
431 aa  295  8e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.44 
 
 
429 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>