More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3344 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  74.13 
 
 		 435 aa  666    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  89.28 
 
 		 446 aa  785    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  100 
 
 		 431 aa  868    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  75.81 
 
 		 431 aa  676    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  75.81 
 
 		 431 aa  676    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  72.33 
 
 		 431 aa  641    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  77.67 
 
 		 431 aa  687    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  75.75 
 
 		 439 aa  632  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  75.41 
 
 		 432 aa  629  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  72.75 
 
 		 441 aa  615  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  71.9 
 
 		 427 aa  605  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  65.89 
 
 		 425 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  65.89 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  65.89 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  65.89 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  66.13 
 
 		 425 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  65.89 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  65.89 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  65.89 
 
 		 425 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  64.27 
 
 		 426 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  65.35 
 
 		 425 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  65.81 
 
 		 425 aa  565  1e-160  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  64.88 
 
 		 425 aa  566  1e-160  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  63.81 
 
 		 425 aa  567  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  64.73 
 
 		 425 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  63.93 
 
 		 425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  65.21 
 
 		 428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  64.75 
 
 		 428 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  65.28 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  65.43 
 
 		 425 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  64.97 
 
 		 425 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  65.43 
 
 		 425 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  64.88 
 
 		 439 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  64.49 
 
 		 448 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  57.64 
 
 		 424 aa  503  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  58.97 
 
 		 424 aa  504  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  59.21 
 
 		 424 aa  500  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  59.53 
 
 		 425 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  50 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  44.76 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.88 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  46.59 
 
 		 426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  46.05 
 
 		 423 aa  358  9e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.33 
 
 		 428 aa  355  1e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  44.86 
 
 		 431 aa  350  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  46.28 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.01 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  44.55 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.05 
 
 		 458 aa  346  4e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  44.42 
 
 		 423 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.12 
 
 		 431 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  45.12 
 
 		 423 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  44.88 
 
 		 423 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.79 
 
 		 427 aa  333  4e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  43.95 
 
 		 423 aa  332  8e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  44.88 
 
 		 423 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  44.88 
 
 		 423 aa  330  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0465  dihydroorotase  44.65 
 
 		 423 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.06 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  40.47 
 
 		 425 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.07 
 
 		 424 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.07 
 
 		 425 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  39.77 
 
 		 427 aa  305  8.000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  41.86 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  40.43 
 
 		 432 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  39.3 
 
 		 436 aa  300  5e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.56 
 
 		 430 aa  299  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.19 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.6 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.92 
 
 		 434 aa  296  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  39.95 
 
 		 428 aa  295  9e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.53 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.49 
 
 		 433 aa  295  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.69 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  37.3 
 
 		 422 aa  293  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  38.84 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  37.3 
 
 		 425 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  39.91 
 
 		 433 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  39.72 
 
 		 433 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  38.79 
 
 		 429 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  39.44 
 
 		 433 aa  282  6.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.47 
 
 		 433 aa  282  7.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.59 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3760  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.85 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.35 
 
 		 424 aa  280  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.07 
 
 		 429 aa  280  5e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.25 
 
 		 430 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  41.07 
 
 		 430 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  38.52 
 
 		 436 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  38.75 
 
 		 433 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  40.23 
 
 		 428 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.07 
 
 		 433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  39.3 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  39.3 
 
 		 428 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.28 
 
 		 439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  36.43 
 
 		 431 aa  272  9e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  38.37 
 
 		 434 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.85 
 
 		 428 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.64 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  37.82 
 
 		 436 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>