More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0481 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  84.56 
 
 		 423 aa  716    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0465  dihydroorotase  82.66 
 
 		 423 aa  686    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  96.69 
 
 		 423 aa  815    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  100 
 
 		 423 aa  836    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  88.6 
 
 		 423 aa  749    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  84.32 
 
 		 423 aa  715    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  78.62 
 
 		 423 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  84.32 
 
 		 423 aa  708    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  78.67 
 
 		 423 aa  659    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  84.8 
 
 		 423 aa  701    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  78.62 
 
 		 423 aa  675    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  53.79 
 
 		 425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  51.31 
 
 		 431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  48.7 
 
 		 429 aa  398  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.52 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.1 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.12 
 
 		 427 aa  385  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.82 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  49.3 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  46.1 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3760  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.98 
 
 		 437 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  47.16 
 
 		 425 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  45.05 
 
 		 425 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  45.43 
 
 		 428 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  45.05 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  45.05 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  45.05 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  45.05 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  45.05 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  45.05 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  45.05 
 
 		 425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  45.99 
 
 		 425 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  45.26 
 
 		 425 aa  352  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  43.16 
 
 		 425 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  45.02 
 
 		 425 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  44.34 
 
 		 425 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  45.75 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  44.5 
 
 		 428 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  45.75 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  44.08 
 
 		 424 aa  345  6e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  45.28 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  44.79 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  44.55 
 
 		 431 aa  336  5.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  43.59 
 
 		 446 aa  336  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.28 
 
 		 458 aa  335  9e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  44.55 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  44.26 
 
 		 435 aa  332  6e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  43.85 
 
 		 431 aa  329  7e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  41.88 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  42.23 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  42.23 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  41.84 
 
 		 425 aa  323  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  44.34 
 
 		 425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  43.97 
 
 		 415 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  45.03 
 
 		 441 aa  314  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  41 
 
 		 425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  45.26 
 
 		 448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.01 
 
 		 425 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  42.22 
 
 		 439 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.05 
 
 		 425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  43.02 
 
 		 427 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  39.24 
 
 		 422 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.28 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.24 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.67 
 
 		 425 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.34 
 
 		 424 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.86 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  44.57 
 
 		 439 aa  299  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  42.59 
 
 		 432 aa  295  8e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.16 
 
 		 429 aa  295  9e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  41.84 
 
 		 428 aa  293  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  40.57 
 
 		 432 aa  292  7e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  38.37 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.37 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.66 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  39.19 
 
 		 431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  38.82 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.22 
 
 		 441 aa  286  5e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.59 
 
 		 442 aa  282  7.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  38.35 
 
 		 427 aa  282  9e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.42 
 
 		 427 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  39.34 
 
 		 428 aa  279  8e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.44 
 
 		 434 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.62 
 
 		 429 aa  276  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.12 
 
 		 434 aa  276  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  34.21 
 
 		 423 aa  275  9e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  39.39 
 
 		 431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.39 
 
 		 425 aa  274  3e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.43 
 
 		 429 aa  273  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.9 
 
 		 433 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  35.53 
 
 		 431 aa  270  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1855  dihydroorotase-like protein  41.6 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000930966  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.63 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0532  putative dihydroorotase-like protein  41.27 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106529 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.29 
 
 		 429 aa  264  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  38.1 
 
 		 436 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  37.86 
 
 		 433 aa  264  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 		 425 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.78 
 
 		 431 aa  262  8.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0543  dihydroorotase  40.72 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>