More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_03110 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  76.6 
 
 
423 aa  652    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  78.44 
 
 
423 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  78.67 
 
 
423 aa  675    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  100 
 
 
423 aa  825    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  76.83 
 
 
423 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  76.83 
 
 
423 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  76.36 
 
 
423 aa  651    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  76.3 
 
 
423 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  80.61 
 
 
423 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  77.25 
 
 
423 aa  633  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0465  dihydroorotase  76.54 
 
 
423 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  53.54 
 
 
425 aa  434  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  52.83 
 
 
429 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  54.63 
 
 
431 aa  421  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.12 
 
 
426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.13 
 
 
431 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.31 
 
 
427 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3760  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.41 
 
 
437 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.17 
 
 
428 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  52.38 
 
 
426 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  47.64 
 
 
424 aa  368  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  47.87 
 
 
425 aa  363  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  46.68 
 
 
425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  46.34 
 
 
425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  46.1 
 
 
425 aa  356  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  46.68 
 
 
425 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  45.39 
 
 
425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  46.48 
 
 
428 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  47.75 
 
 
425 aa  352  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  46.1 
 
 
425 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  46.1 
 
 
425 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  46.1 
 
 
425 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  46.1 
 
 
425 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  46.1 
 
 
425 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  46.1 
 
 
425 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  46.24 
 
 
428 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  47.52 
 
 
425 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  47.75 
 
 
425 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  46.1 
 
 
425 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  47.75 
 
 
425 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.53 
 
 
458 aa  346  5e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  46.21 
 
 
424 aa  345  7e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  45.99 
 
 
424 aa  341  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  45.12 
 
 
431 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  44.6 
 
 
435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  44.42 
 
 
431 aa  335  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  44.32 
 
 
446 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  44.42 
 
 
431 aa  335  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  46.23 
 
 
415 aa  334  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  43.63 
 
 
426 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  44.88 
 
 
431 aa  332  8e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  43.71 
 
 
425 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  42.79 
 
 
431 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  44.21 
 
 
439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  44.8 
 
 
427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  42.55 
 
 
425 aa  318  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  45.01 
 
 
432 aa  315  8e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  44.1 
 
 
425 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.19 
 
 
425 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.33 
 
 
425 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  46.21 
 
 
448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.33 
 
 
424 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  45.16 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  38.66 
 
 
422 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.88 
 
 
425 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.14 
 
 
439 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.24 
 
 
425 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  38.26 
 
 
436 aa  297  3e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.63 
 
 
429 aa  295  8e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  44.37 
 
 
439 aa  294  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  41.36 
 
 
428 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.53 
 
 
424 aa  291  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  37.56 
 
 
427 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.33 
 
 
433 aa  286  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  42.02 
 
 
432 aa  286  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.8 
 
 
442 aa  286  7e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  35.73 
 
 
426 aa  286  7e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.12 
 
 
428 aa  285  9e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.15 
 
 
436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.99 
 
 
433 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.53 
 
 
441 aa  279  6e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.71 
 
 
429 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  37.62 
 
 
431 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  38.03 
 
 
428 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.71 
 
 
429 aa  276  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.41 
 
 
434 aa  276  7e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.98 
 
 
434 aa  275  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.71 
 
 
427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  34.13 
 
 
423 aa  272  9e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.2 
 
 
433 aa  272  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.95 
 
 
434 aa  272  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.09 
 
 
429 aa  271  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  34.91 
 
 
431 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0532  putative dihydroorotase-like protein  41.44 
 
 
393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0106529 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.99 
 
 
433 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.99 
 
 
433 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.1 
 
 
434 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.08 
 
 
433 aa  269  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  42.99 
 
 
433 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1855  dihydroorotase-like protein  40.58 
 
 
383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000930966  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>