More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0942 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
427 aa  832    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  57.92 
 
 
426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.87 
 
 
426 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  53.55 
 
 
431 aa  425  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  48.69 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  49.64 
 
 
425 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.43 
 
 
431 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  51.19 
 
 
423 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  48.69 
 
 
425 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  48.69 
 
 
425 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.59 
 
 
423 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  50.12 
 
 
423 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  50.36 
 
 
423 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.39 
 
 
428 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  51.67 
 
 
423 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  47.03 
 
 
425 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  49.76 
 
 
423 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  49.52 
 
 
423 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  49.64 
 
 
423 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  51.31 
 
 
423 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  45.37 
 
 
424 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  49.52 
 
 
423 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.23 
 
 
458 aa  362  6e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  45.37 
 
 
424 aa  360  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  48.46 
 
 
448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  45.63 
 
 
425 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0465  dihydroorotase  48.33 
 
 
423 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  45.39 
 
 
439 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  45.67 
 
 
428 aa  354  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  45.77 
 
 
428 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  47.27 
 
 
424 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  46.1 
 
 
425 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  46.34 
 
 
425 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  46.34 
 
 
425 aa  348  9e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  44.68 
 
 
425 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  44.68 
 
 
425 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  44.68 
 
 
425 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  44.68 
 
 
425 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  44.68 
 
 
425 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  44.68 
 
 
425 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  44.68 
 
 
425 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  45.75 
 
 
425 aa  346  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  44.44 
 
 
425 aa  346  5e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  43.16 
 
 
426 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  44.21 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  42.08 
 
 
425 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  44.19 
 
 
431 aa  335  7e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  44.19 
 
 
431 aa  335  7e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  42.79 
 
 
425 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  45.35 
 
 
431 aa  334  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  43.84 
 
 
425 aa  333  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  43.49 
 
 
431 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  45.13 
 
 
415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  42.79 
 
 
431 aa  326  5e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3760  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.37 
 
 
437 aa  326  5e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  44.08 
 
 
432 aa  326  6e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  43.9 
 
 
427 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.86 
 
 
424 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  42.29 
 
 
446 aa  321  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  39.05 
 
 
422 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.09 
 
 
425 aa  319  6e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  45.6 
 
 
441 aa  318  9e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  45.75 
 
 
439 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.19 
 
 
424 aa  312  9e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.04 
 
 
425 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  41.81 
 
 
425 aa  310  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  39 
 
 
425 aa  309  8e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  39.86 
 
 
427 aa  302  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.73 
 
 
434 aa  301  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  39.62 
 
 
436 aa  301  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.72 
 
 
425 aa  300  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.14 
 
 
429 aa  296  5e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.83 
 
 
442 aa  292  6e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  39.91 
 
 
428 aa  290  3e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.84 
 
 
433 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.6 
 
 
433 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.94 
 
 
433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  37.05 
 
 
431 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  40.52 
 
 
428 aa  286  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  35.71 
 
 
423 aa  281  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  43.13 
 
 
433 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  40.09 
 
 
428 aa  279  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.33 
 
 
429 aa  278  1e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.2 
 
 
436 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0532  putative dihydroorotase-like protein  39.45 
 
 
393 aa  276  4e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0106529 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  35.17 
 
 
426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.17 
 
 
428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  40.48 
 
 
431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1855  dihydroorotase-like protein  38.68 
 
 
383 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000930966  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0543  dihydroorotase  38.9 
 
 
403 aa  272  9e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.89 
 
 
441 aa  272  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2665  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.05 
 
 
424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3058  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.05 
 
 
424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.29 
 
 
434 aa  269  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  38.23 
 
 
428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.2 
 
 
425 aa  266  4e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  38 
 
 
428 aa  266  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.6 
 
 
434 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.38 
 
 
497 aa  265  8e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.05 
 
 
433 aa  263  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>