More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0623 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  73.52 
 
 		 425 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  93.41 
 
 		 425 aa  816    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  73.29 
 
 		 425 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  73.52 
 
 		 425 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  80.33 
 
 		 448 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  99.06 
 
 		 425 aa  856    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  73.52 
 
 		 425 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  73.29 
 
 		 425 aa  642    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  72.58 
 
 		 425 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  73.11 
 
 		 426 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  80.38 
 
 		 439 aa  697    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  73.52 
 
 		 425 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  73.52 
 
 		 425 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  100 
 
 		 425 aa  862    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  73.52 
 
 		 425 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  73.22 
 
 		 425 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  71.29 
 
 		 425 aa  621  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  71.6 
 
 		 428 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  71.03 
 
 		 428 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  71.53 
 
 		 425 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  71.29 
 
 		 425 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  71.53 
 
 		 425 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  70.92 
 
 		 425 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  66.28 
 
 		 446 aa  580  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  65.81 
 
 		 431 aa  571  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  63.49 
 
 		 431 aa  554  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  62.79 
 
 		 431 aa  552  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  62.79 
 
 		 431 aa  552  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  64.88 
 
 		 431 aa  553  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  65.44 
 
 		 439 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  63.74 
 
 		 424 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  62.41 
 
 		 424 aa  538  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  61.07 
 
 		 435 aa  535  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  63.47 
 
 		 427 aa  534  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  64.75 
 
 		 441 aa  534  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  62.35 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  60.19 
 
 		 424 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  57.54 
 
 		 432 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  56.16 
 
 		 415 aa  463  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.94 
 
 		 426 aa  415  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  47.63 
 
 		 429 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.69 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  47.41 
 
 		 431 aa  381  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  49.17 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.16 
 
 		 431 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  47.17 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.7 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  43.36 
 
 		 425 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  47.41 
 
 		 423 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.79 
 
 		 428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.26 
 
 		 423 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  45.26 
 
 		 423 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  44.79 
 
 		 423 aa  345  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  43.97 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  43.97 
 
 		 423 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  46.68 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  44.55 
 
 		 423 aa  342  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.47 
 
 		 425 aa  335  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  43.74 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0465  dihydroorotase  43.63 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.28 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  41.22 
 
 		 427 aa  323  3e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.84 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.39 
 
 		 425 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  40.75 
 
 		 436 aa  316  6e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  39.71 
 
 		 422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  40.05 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  41.98 
 
 		 438 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.45 
 
 		 433 aa  310  5e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.52 
 
 		 430 aa  310  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.89 
 
 		 434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.81 
 
 		 425 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  40.85 
 
 		 428 aa  307  3e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  39.29 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.1 
 
 		 425 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.91 
 
 		 434 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.42 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  40.91 
 
 		 432 aa  300  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  39.43 
 
 		 431 aa  299  8e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.15 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.81 
 
 		 430 aa  297  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.75 
 
 		 429 aa  295  7e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.57 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  39.53 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  38.35 
 
 		 436 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  40.62 
 
 		 428 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  39.67 
 
 		 428 aa  287  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  37.65 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.77 
 
 		 429 aa  286  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  39.67 
 
 		 428 aa  286  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.72 
 
 		 429 aa  285  7e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  37.88 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1855  dihydroorotase-like protein  41.67 
 
 		 383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000930966  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0532  putative dihydroorotase-like protein  41.32 
 
 		 393 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106529 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  38.44 
 
 		 429 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  38.12 
 
 		 433 aa  282  7.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  39.76 
 
 		 437 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.23 
 
 		 428 aa  282  9e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  37.88 
 
 		 436 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.24 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>