More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2583 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  100 
 
 		 424 aa  855    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  63.83 
 
 		 425 aa  547  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  62.41 
 
 		 425 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  62.41 
 
 		 425 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  61.23 
 
 		 425 aa  531  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  61.47 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  61.47 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  61.47 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  61.47 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  61.23 
 
 		 425 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  61.47 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  61.47 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  62.8 
 
 		 424 aa  522  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  59.76 
 
 		 426 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  58.96 
 
 		 425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  59.57 
 
 		 425 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  59.39 
 
 		 428 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  62.26 
 
 		 439 aa  507  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  59.15 
 
 		 428 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  58.87 
 
 		 425 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  60.52 
 
 		 425 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  60.76 
 
 		 425 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  60.76 
 
 		 425 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  63.03 
 
 		 448 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  60.05 
 
 		 425 aa  497  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  60.61 
 
 		 424 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  57.64 
 
 		 431 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  56.12 
 
 		 446 aa  490  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  57.21 
 
 		 431 aa  474  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  56.05 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  58.96 
 
 		 425 aa  475  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  56.05 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  58.29 
 
 		 441 aa  468  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  56.28 
 
 		 431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  56.41 
 
 		 435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  56.47 
 
 		 427 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  57.67 
 
 		 439 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  54.52 
 
 		 432 aa  440  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  50.24 
 
 		 415 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  46.12 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  49.52 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  48.46 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.17 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.97 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  47.41 
 
 		 423 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  48.94 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  47.41 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  47.17 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.04 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  46.79 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  46.1 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.87 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  46.7 
 
 		 423 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  45.52 
 
 		 423 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0465  dihydroorotase  46.57 
 
 		 423 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  47.64 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.27 
 
 		 427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.45 
 
 		 458 aa  347  3e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  40.57 
 
 		 425 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  41.23 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  38.48 
 
 		 422 aa  310  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  39.76 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.17 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.26 
 
 		 424 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.81 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.97 
 
 		 425 aa  299  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  38.17 
 
 		 436 aa  299  7e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  37.65 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.85 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.43 
 
 		 430 aa  297  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.59 
 
 		 425 aa  296  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.03 
 
 		 429 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  38.86 
 
 		 432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  35.55 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0532  putative dihydroorotase-like protein  41.76 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106529 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1855  dihydroorotase-like protein  42.03 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000930966  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.09 
 
 		 424 aa  282  9e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0543  dihydroorotase  40.92 
 
 		 403 aa  281  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  37.85 
 
 		 428 aa  280  3e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  37.32 
 
 		 431 aa  279  8e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.95 
 
 		 430 aa  277  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  38.53 
 
 		 429 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.71 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.73 
 
 		 433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.15 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.76 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3760  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.2 
 
 		 437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.91 
 
 		 429 aa  273  6e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.61 
 
 		 434 aa  272  7e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  34.27 
 
 		 431 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.36 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.68 
 
 		 434 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  37.88 
 
 		 434 aa  269  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.41 
 
 		 428 aa  267  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.79 
 
 		 433 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.69 
 
 		 427 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  33.81 
 
 		 426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.03 
 
 		 429 aa  266  5e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.36 
 
 		 473 aa  266  8e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.92 
 
 		 429 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>