More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1381 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  77.16 
 
 		 431 aa  680    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  74.13 
 
 		 431 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  77.16 
 
 		 431 aa  680    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  72.56 
 
 		 431 aa  644    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  100 
 
 		 435 aa  878    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  74.54 
 
 		 446 aa  665    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  76.46 
 
 		 431 aa  667    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  71.46 
 
 		 432 aa  611  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  71.06 
 
 		 427 aa  595  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  71.99 
 
 		 439 aa  597  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  68.2 
 
 		 441 aa  575  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  64.97 
 
 		 425 aa  558  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  63.57 
 
 		 426 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  64.97 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  64.97 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  64.97 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  64.97 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  64.97 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  64.73 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  64.97 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  63.02 
 
 		 425 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  61.95 
 
 		 425 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  62.24 
 
 		 425 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  62.65 
 
 		 425 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  62.67 
 
 		 428 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  63.81 
 
 		 425 aa  535  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  61.07 
 
 		 425 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  64.04 
 
 		 425 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  64.04 
 
 		 425 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  62.67 
 
 		 428 aa  534  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  63.34 
 
 		 425 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  60.84 
 
 		 425 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  61.4 
 
 		 439 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  61.12 
 
 		 448 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  58.41 
 
 		 424 aa  490  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  56.78 
 
 		 424 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  58.51 
 
 		 425 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  56.41 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  49.42 
 
 		 415 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  44.94 
 
 		 429 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  46.82 
 
 		 426 aa  363  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  44.86 
 
 		 431 aa  362  9e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.93 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.53 
 
 		 428 aa  348  8e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.55 
 
 		 458 aa  345  7e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.46 
 
 		 431 aa  341  1e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  43.59 
 
 		 423 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.21 
 
 		 427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  44.26 
 
 		 423 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  43.82 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  43.59 
 
 		 423 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.56 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  43.59 
 
 		 423 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  43.59 
 
 		 423 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  44.6 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  43.19 
 
 		 423 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0465  dihydroorotase  43.79 
 
 		 423 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  42.02 
 
 		 423 aa  316  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  40.42 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.69 
 
 		 424 aa  312  9e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  40.42 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.69 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.16 
 
 		 425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  38.97 
 
 		 425 aa  306  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  38.46 
 
 		 422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  41.23 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  38.93 
 
 		 428 aa  301  1e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.03 
 
 		 433 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.6 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  37.44 
 
 		 425 aa  296  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.96 
 
 		 425 aa  293  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.93 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3760  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.73 
 
 		 437 aa  289  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.67 
 
 		 429 aa  289  7e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  37.93 
 
 		 428 aa  289  8e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.64 
 
 		 425 aa  288  9e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  40.7 
 
 		 438 aa  289  9e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  39.02 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  38.52 
 
 		 431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.95 
 
 		 433 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  39.03 
 
 		 428 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.18 
 
 		 434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  39.03 
 
 		 428 aa  283  5.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.71 
 
 		 430 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.35 
 
 		 430 aa  281  2e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.3 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  39.26 
 
 		 428 aa  277  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  37.03 
 
 		 431 aa  275  9e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  38.19 
 
 		 436 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  37.88 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.93 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  38.43 
 
 		 433 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.34 
 
 		 429 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  38.89 
 
 		 433 aa  273  6e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  34.11 
 
 		 431 aa  272  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.41 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  37.27 
 
 		 433 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.78 
 
 		 434 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  37.04 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.83 
 
 		 433 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>