More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3958 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  81.51 
 
 		 439 aa  662    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  100 
 
 		 441 aa  873    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  72.52 
 
 		 446 aa  627  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  72.98 
 
 		 431 aa  616  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  72.75 
 
 		 431 aa  616  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  72.06 
 
 		 431 aa  610  1e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  72.06 
 
 		 431 aa  610  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  71.03 
 
 		 431 aa  607  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  68.2 
 
 		 435 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  71.3 
 
 		 427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  70.18 
 
 		 432 aa  565  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  66.13 
 
 		 425 aa  558  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  64.29 
 
 		 425 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  64.75 
 
 		 425 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  66.06 
 
 		 425 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  66.06 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  66.06 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  66.06 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  66.06 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  66.06 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  64.22 
 
 		 426 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  66.06 
 
 		 425 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  66.06 
 
 		 425 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  64.6 
 
 		 439 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  62.61 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  63.13 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  63.84 
 
 		 428 aa  521  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  62.9 
 
 		 425 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  62.7 
 
 		 428 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  63.36 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  63.43 
 
 		 448 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  63.36 
 
 		 425 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  63.36 
 
 		 425 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  62.9 
 
 		 425 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  58.29 
 
 		 424 aa  482  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  59.91 
 
 		 425 aa  478  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  57.74 
 
 		 424 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  56.12 
 
 		 424 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  52.07 
 
 		 415 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.85 
 
 		 426 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  45.71 
 
 		 429 aa  363  4e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  47.64 
 
 		 426 aa  349  5e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  44.91 
 
 		 431 aa  342  7e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  46.08 
 
 		 423 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.63 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  46.08 
 
 		 423 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.45 
 
 		 431 aa  336  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  46.56 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  46.33 
 
 		 423 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.73 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.6 
 
 		 427 aa  329  6e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  45.03 
 
 		 423 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  46.54 
 
 		 423 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  46.33 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.19 
 
 		 458 aa  323  4e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  43.55 
 
 		 423 aa  316  7e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  45.16 
 
 		 423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0465  dihydroorotase  44.95 
 
 		 423 aa  309  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  41.01 
 
 		 425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  40.78 
 
 		 436 aa  296  3e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  40.92 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  39.86 
 
 		 427 aa  290  4e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.69 
 
 		 433 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  41.71 
 
 		 438 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.8 
 
 		 424 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  39.3 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  39.81 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.57 
 
 		 425 aa  277  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  37.27 
 
 		 422 aa  276  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.79 
 
 		 425 aa  275  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.47 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  38.16 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.33 
 
 		 424 aa  273  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.51 
 
 		 434 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.01 
 
 		 425 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.91 
 
 		 429 aa  272  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3760  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.6 
 
 		 437 aa  270  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.26 
 
 		 430 aa  269  8e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  37.13 
 
 		 431 aa  268  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  35.17 
 
 		 431 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  37.9 
 
 		 429 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.77 
 
 		 434 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.36 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  39.13 
 
 		 433 aa  262  8e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  38.85 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  39.59 
 
 		 433 aa  260  4e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.77 
 
 		 434 aa  260  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.59 
 
 		 434 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  38.16 
 
 		 433 aa  259  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.95 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  37.99 
 
 		 434 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  38.48 
 
 		 428 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  38.48 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  39.4 
 
 		 428 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.09 
 
 		 488 aa  252  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.61 
 
 		 497 aa  252  9.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  39.54 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  37.24 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.3 
 
 		 430 aa  251  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0532  putative dihydroorotase-like protein  40 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0106529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>