More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2528 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  75.71 
 
 
425 aa  669    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  74.64 
 
 
425 aa  661    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  72.75 
 
 
422 aa  650    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  71.16 
 
 
424 aa  635    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
424 aa  858    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  73.76 
 
 
425 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  70.69 
 
 
425 aa  633  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  61.7 
 
 
425 aa  552  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  56.5 
 
 
426 aa  499  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.24 
 
 
428 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.59 
 
 
429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  57.01 
 
 
429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.73 
 
 
436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  55.21 
 
 
433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.8 
 
 
439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.01 
 
 
427 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.98 
 
 
433 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  54.74 
 
 
433 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.74 
 
 
433 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.72 
 
 
442 aa  425  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  48.58 
 
 
431 aa  425  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  50.47 
 
 
431 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  51.18 
 
 
428 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.35 
 
 
429 aa  413  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  47.06 
 
 
431 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.46 
 
 
434 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.18 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  46.71 
 
 
427 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  46.48 
 
 
425 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  46.24 
 
 
436 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  50.26 
 
 
425 aa  396  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.39 
 
 
430 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.41 
 
 
429 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.63 
 
 
425 aa  392  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  46.59 
 
 
426 aa  395  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  46.37 
 
 
428 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.17 
 
 
434 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.14 
 
 
431 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  45.05 
 
 
426 aa  387  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.29 
 
 
430 aa  385  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  42.99 
 
 
423 aa  384  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.32 
 
 
434 aa  383  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.95 
 
 
430 aa  378  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  45.33 
 
 
429 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.23 
 
 
432 aa  370  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.59 
 
 
473 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.52 
 
 
429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.15 
 
 
435 aa  361  1e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  48.83 
 
 
428 aa  361  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  43.81 
 
 
459 aa  358  9.999999999999999e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.4 
 
 
425 aa  358  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.23 
 
 
437 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.19 
 
 
430 aa  355  5.999999999999999e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  45.08 
 
 
432 aa  349  4e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  43.91 
 
 
446 aa  349  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.47 
 
 
447 aa  348  1e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  46.43 
 
 
431 aa  346  4e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.77 
 
 
448 aa  346  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  45.88 
 
 
430 aa  346  5e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.04 
 
 
497 aa  345  8e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  41.81 
 
 
447 aa  345  1e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  41.88 
 
 
427 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1870  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.73 
 
 
420 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  42.82 
 
 
428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  46.4 
 
 
430 aa  342  5e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0898  dihydroorotase  43.58 
 
 
442 aa  342  7e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.45 
 
 
433 aa  342  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  41.88 
 
 
428 aa  341  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.65 
 
 
437 aa  341  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  44.6 
 
 
440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  42.35 
 
 
428 aa  339  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.37 
 
 
430 aa  339  5.9999999999999996e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  42.35 
 
 
428 aa  338  8e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  42.35 
 
 
428 aa  338  9e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  42.59 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.14 
 
 
438 aa  338  9.999999999999999e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  42.12 
 
 
428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  42.12 
 
 
428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  42.12 
 
 
428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  42.12 
 
 
428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  42.12 
 
 
428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.17 
 
 
433 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  47.69 
 
 
458 aa  336  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  47.38 
 
 
425 aa  336  5e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  46.93 
 
 
446 aa  336  5.999999999999999e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  46.63 
 
 
425 aa  335  7e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.82 
 
 
488 aa  335  7e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  45.63 
 
 
432 aa  335  7e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  46.47 
 
 
431 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.76 
 
 
497 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3119  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 
419 aa  333  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317311  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.57 
 
 
426 aa  333  5e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  40.86 
 
 
425 aa  331  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  41.69 
 
 
442 aa  330  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  45.72 
 
 
432 aa  330  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  44.96 
 
 
449 aa  329  6e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  41.61 
 
 
433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  45.16 
 
 
432 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1038  dihydroorotase  41.32 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.933737  hitchhiker  0.00310904 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1262  dihydroorotase  41.18 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>