More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1200 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  100 
 
 
427 aa  865    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  96.25 
 
 
436 aa  837    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  86.18 
 
 
428 aa  735    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  50.82 
 
 
431 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.78 
 
 
473 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.4 
 
 
429 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.16 
 
 
497 aa  420  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.76 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.52 
 
 
497 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.12 
 
 
425 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  51.18 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  50 
 
 
434 aa  413  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.49 
 
 
436 aa  415  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  50 
 
 
429 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  49.06 
 
 
426 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  47 
 
 
488 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  49.3 
 
 
425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  47.88 
 
 
422 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.18 
 
 
425 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.71 
 
 
424 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.71 
 
 
424 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.76 
 
 
425 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  50.82 
 
 
433 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.54 
 
 
427 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.88 
 
 
433 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  49.06 
 
 
431 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.2 
 
 
428 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.78 
 
 
430 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.12 
 
 
425 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.88 
 
 
433 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.1 
 
 
441 aa  386  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.36 
 
 
429 aa  385  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.81 
 
 
429 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.42 
 
 
448 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.96 
 
 
426 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.28 
 
 
431 aa  375  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.88 
 
 
434 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  45.65 
 
 
423 aa  368  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.28 
 
 
425 aa  365  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.81 
 
 
432 aa  364  2e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.27 
 
 
434 aa  359  4e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.92 
 
 
430 aa  358  9e-98  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  46.03 
 
 
428 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  44.86 
 
 
427 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  46.03 
 
 
428 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  46.03 
 
 
428 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  44.6 
 
 
429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.21 
 
 
430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  45.56 
 
 
428 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  45.79 
 
 
428 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  45.79 
 
 
428 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  45.79 
 
 
428 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  45.18 
 
 
426 aa  355  1e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  45.79 
 
 
428 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.43 
 
 
439 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  44.37 
 
 
426 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  45.56 
 
 
428 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.14 
 
 
442 aa  352  5e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  44.84 
 
 
425 aa  352  8e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  45.33 
 
 
428 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.76 
 
 
430 aa  351  1e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  45.09 
 
 
428 aa  350  4e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  44.34 
 
 
430 aa  349  7e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  43.82 
 
 
428 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  43.53 
 
 
428 aa  341  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.27 
 
 
435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  42.82 
 
 
432 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  43.06 
 
 
447 aa  336  5.999999999999999e-91  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.21 
 
 
429 aa  334  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.59 
 
 
425 aa  334  1e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.86 
 
 
438 aa  333  3e-90  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.19 
 
 
433 aa  333  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  42.15 
 
 
425 aa  331  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  42.15 
 
 
425 aa  331  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  42.09 
 
 
431 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  41.55 
 
 
425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  40.47 
 
 
429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  41.55 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  42.79 
 
 
431 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  41.45 
 
 
425 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.42 
 
 
433 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  43.22 
 
 
425 aa  326  5e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  44.66 
 
 
430 aa  326  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.98 
 
 
433 aa  325  9e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  41.82 
 
 
459 aa  324  2e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  43.1 
 
 
462 aa  324  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  41.22 
 
 
425 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  43.1 
 
 
432 aa  323  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  42.26 
 
 
449 aa  323  4e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  41.3 
 
 
431 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  41.3 
 
 
431 aa  323  5e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  42.62 
 
 
431 aa  322  6e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  41.3 
 
 
431 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  43.45 
 
 
435 aa  322  7e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  41.16 
 
 
427 aa  322  8e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.08 
 
 
447 aa  322  8e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1038  dihydroorotase  40.84 
 
 
440 aa  321  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.933737  hitchhiker  0.00310904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  41.57 
 
 
442 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.82 
 
 
433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  42.79 
 
 
425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>