More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3104 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  83.8 
 
 		 431 aa  707    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  75.06 
 
 		 431 aa  641    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  78.59 
 
 		 429 aa  656    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  75.06 
 
 		 433 aa  634    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  78.3 
 
 		 430 aa  639    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 433 aa  860    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  75.59 
 
 		 430 aa  630  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  75 
 
 		 432 aa  630  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  73.88 
 
 		 433 aa  617  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  72.75 
 
 		 462 aa  615  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  71.17 
 
 		 449 aa  612  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  73.65 
 
 		 437 aa  608  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  73.24 
 
 		 432 aa  608  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1707  dihydroorotase  71.91 
 
 		 451 aa  604  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  74 
 
 		 428 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  72.94 
 
 		 458 aa  599  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  73.88 
 
 		 428 aa  591  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  69.77 
 
 		 448 aa  593  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  70.28 
 
 		 446 aa  570  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  69.34 
 
 		 425 aa  559  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  69.88 
 
 		 432 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1324  dihydroorotase  66.44 
 
 		 454 aa  555  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.198693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  68.63 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12610  dihydroorotase  66.82 
 
 		 459 aa  553  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0812321  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  69.41 
 
 		 435 aa  550  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5244  dihydroorotase  63.05 
 
 		 433 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937093  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  61.41 
 
 		 431 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  58.73 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  58.73 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  58.73 
 
 		 431 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  57.98 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  57.38 
 
 		 442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12670  dihydroorotase  60.42 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0696106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  57.78 
 
 		 427 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2337  dihydroorotase, multifunctional complex type  57.94 
 
 		 436 aa  459  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.74 
 
 		 437 aa  457  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.85 
 
 		 429 aa  365  1e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  50 
 
 		 436 aa  358  7e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.33 
 
 		 429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.5 
 
 		 429 aa  352  7e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.54 
 
 		 430 aa  348  9e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  44.03 
 
 		 431 aa  341  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  46.08 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  45.02 
 
 		 422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.17 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  43.28 
 
 		 426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  44.55 
 
 		 431 aa  336  5.999999999999999e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.84 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.42 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  46.4 
 
 		 431 aa  333  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  44.42 
 
 		 427 aa  332  7.000000000000001e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.31 
 
 		 424 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.64 
 
 		 442 aa  330  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.36 
 
 		 427 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.08 
 
 		 425 aa  328  9e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.43 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  43.92 
 
 		 436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.44 
 
 		 425 aa  326  6e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.26 
 
 		 439 aa  326  6e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4891  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.88 
 
 		 447 aa  325  8.000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0481803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.81 
 
 		 425 aa  323  5e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.41 
 
 		 434 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.28 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.15 
 
 		 430 aa  320  3.9999999999999996e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.1 
 
 		 425 aa  318  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.05 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  43.23 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.86 
 
 		 435 aa  313  4.999999999999999e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  39.41 
 
 		 423 aa  310  4e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0124  dihydroorotase  40.52 
 
 		 430 aa  307  3e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00282243  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.99 
 
 		 430 aa  306  6e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.4 
 
 		 473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.68 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.48 
 
 		 430 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.55 
 
 		 426 aa  301  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  40.05 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2965  dihydroorotase  45.63 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.322465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  46.51 
 
 		 433 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  42.17 
 
 		 429 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  40.39 
 
 		 428 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.2 
 
 		 433 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  38.26 
 
 		 430 aa  294  2e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.15 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.74 
 
 		 437 aa  293  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0463  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.52 
 
 		 422 aa  293  6e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0936737 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  39.66 
 
 		 428 aa  292  8e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  43.26 
 
 		 428 aa  292  8e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  43.13 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  40.97 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  40.97 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  40.97 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.96 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  41.22 
 
 		 428 aa  289  6e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  40.97 
 
 		 428 aa  289  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.94 
 
 		 425 aa  289  8e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  40.97 
 
 		 428 aa  288  9e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  40.97 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  40.97 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  40.46 
 
 		 428 aa  287  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  41.46 
 
 		 425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>