More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2584 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  77 
 
 		 431 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  76.06 
 
 		 430 aa  653    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  75 
 
 		 442 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  76.76 
 
 		 431 aa  659    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 437 aa  863    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  76.76 
 
 		 431 aa  659    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  74.88 
 
 		 427 aa  634  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2337  dihydroorotase, multifunctional complex type  75.06 
 
 		 436 aa  626  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  70.82 
 
 		 431 aa  593  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5244  dihydroorotase  70.56 
 
 		 433 aa  579  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937093  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  62.18 
 
 		 435 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  63.32 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  63.2 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  61.83 
 
 		 425 aa  485  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  59.62 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  59.81 
 
 		 432 aa  481  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  58.96 
 
 		 431 aa  477  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  60.19 
 
 		 425 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  57.24 
 
 		 449 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  58.41 
 
 		 446 aa  472  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  58.35 
 
 		 429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  58.43 
 
 		 437 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  57.79 
 
 		 462 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  59.57 
 
 		 431 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  57.77 
 
 		 432 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  56.68 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  58.58 
 
 		 458 aa  461  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  57.51 
 
 		 430 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  57.65 
 
 		 430 aa  461  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  57.97 
 
 		 432 aa  460  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  58.14 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.74 
 
 		 433 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1707  dihydroorotase  57.3 
 
 		 451 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1324  dihydroorotase  55.25 
 
 		 454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.198693 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12610  dihydroorotase  53.51 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0812321  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12670  dihydroorotase  56.7 
 
 		 446 aa  410  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0696106 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.37 
 
 		 429 aa  349  5e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  46.7 
 
 		 431 aa  336  5.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  43.72 
 
 		 423 aa  332  9e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.02 
 
 		 436 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.03 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.16 
 
 		 424 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  40.84 
 
 		 431 aa  325  8.000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.9 
 
 		 425 aa  325  9e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  43.46 
 
 		 425 aa  323  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  42.03 
 
 		 427 aa  320  3e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.87 
 
 		 427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  39.58 
 
 		 431 aa  320  5e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  41.89 
 
 		 422 aa  318  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  39.8 
 
 		 426 aa  316  5e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.55 
 
 		 425 aa  316  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.87 
 
 		 439 aa  315  7e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  41.2 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.68 
 
 		 425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.86 
 
 		 425 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.8 
 
 		 429 aa  312  6.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.62 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.4 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.1 
 
 		 473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4891  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.21 
 
 		 447 aa  309  8e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0481803  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.47 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.72 
 
 		 431 aa  306  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.39 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.07 
 
 		 430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  37.47 
 
 		 426 aa  299  5e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.65 
 
 		 430 aa  296  5e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.79 
 
 		 435 aa  295  9e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.27 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  40.14 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.73 
 
 		 434 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  38.61 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.5 
 
 		 434 aa  293  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.31 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.12 
 
 		 425 aa  290  4e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.12 
 
 		 428 aa  290  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0463  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.8 
 
 		 422 aa  289  8e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0936737 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  39.58 
 
 		 427 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  38.83 
 
 		 425 aa  286  5e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2965  dihydroorotase  44.44 
 
 		 426 aa  285  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.322465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.49 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  39.12 
 
 		 430 aa  285  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  37.86 
 
 		 425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1306  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.7 
 
 		 431 aa  281  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  39.01 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  40.83 
 
 		 429 aa  280  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.36 
 
 		 497 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  38.84 
 
 		 428 aa  279  6e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  42 
 
 		 488 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.48 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  38.14 
 
 		 428 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  39.07 
 
 		 428 aa  276  5e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.36 
 
 		 430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  38.37 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  38.37 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0124  dihydroorotase  36.83 
 
 		 430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00282243  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.82 
 
 		 497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  38.37 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  38.14 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  37.24 
 
 		 425 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  37.24 
 
 		 425 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>