More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1854 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  94.59 
 
 
425 aa  805    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  100 
 
 
425 aa  838    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  73.47 
 
 
432 aa  623  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  72.16 
 
 
432 aa  595  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  71.29 
 
 
431 aa  591  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  71.36 
 
 
430 aa  588  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  74.12 
 
 
428 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  70.3 
 
 
431 aa  578  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  70.07 
 
 
428 aa  579  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  68.76 
 
 
429 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  69.68 
 
 
433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  69.16 
 
 
430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  67.45 
 
 
449 aa  568  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  69.86 
 
 
437 aa  567  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  68.34 
 
 
458 aa  566  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  66.59 
 
 
462 aa  558  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  69.01 
 
 
432 aa  560  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1707  dihydroorotase  70.87 
 
 
451 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  68.37 
 
 
433 aa  557  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  68.63 
 
 
433 aa  553  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  67.21 
 
 
435 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  65.08 
 
 
448 aa  543  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1324  dihydroorotase  63.82 
 
 
454 aa  530  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.198693 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  62.15 
 
 
431 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5244  dihydroorotase  61.57 
 
 
433 aa  500  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937093  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12610  dihydroorotase  63.48 
 
 
459 aa  497  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0812321  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  62.38 
 
 
446 aa  480  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  60.49 
 
 
427 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  60.19 
 
 
437 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  60.44 
 
 
442 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2337  dihydroorotase, multifunctional complex type  59.72 
 
 
436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  56.67 
 
 
431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  56.67 
 
 
431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  56.67 
 
 
431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  58.29 
 
 
430 aa  450  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12670  dihydroorotase  60.82 
 
 
446 aa  434  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0696106 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.36 
 
 
429 aa  362  8e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.5 
 
 
429 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.13 
 
 
436 aa  343  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.53 
 
 
427 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.38 
 
 
424 aa  336  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.26 
 
 
429 aa  335  7e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.48 
 
 
441 aa  333  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.43 
 
 
424 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  44.2 
 
 
431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.06 
 
 
439 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.98 
 
 
434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.19 
 
 
425 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  46.73 
 
 
431 aa  324  2e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  42.72 
 
 
425 aa  323  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  43.03 
 
 
422 aa  323  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.78 
 
 
425 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.5 
 
 
473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.57 
 
 
433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  41.73 
 
 
431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  40.49 
 
 
426 aa  319  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.64 
 
 
425 aa  318  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  42.18 
 
 
436 aa  315  8e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.54 
 
 
425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.93 
 
 
430 aa  313  4.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  42.18 
 
 
427 aa  312  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.34 
 
 
442 aa  312  7.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.42 
 
 
435 aa  310  2e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.95 
 
 
434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.4 
 
 
431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.39 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.86 
 
 
430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4891  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.09 
 
 
447 aa  302  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0481803  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.11 
 
 
432 aa  300  4e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.26 
 
 
434 aa  299  8e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.27 
 
 
430 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  41.73 
 
 
428 aa  296  4e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  38.48 
 
 
426 aa  296  6e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  46.97 
 
 
433 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.74 
 
 
425 aa  295  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.96 
 
 
497 aa  293  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.22 
 
 
433 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.22 
 
 
433 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  41.08 
 
 
428 aa  292  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.32 
 
 
429 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.49 
 
 
497 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  41.02 
 
 
429 aa  290  5.0000000000000004e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  41.08 
 
 
428 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  41.81 
 
 
428 aa  288  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  41.81 
 
 
428 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  40.85 
 
 
428 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  41.81 
 
 
428 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.2 
 
 
430 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  41.56 
 
 
428 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  41.32 
 
 
428 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  40.05 
 
 
423 aa  286  5e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  41.56 
 
 
428 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  41.56 
 
 
428 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  41.56 
 
 
428 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  37.37 
 
 
426 aa  286  5e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.57 
 
 
488 aa  280  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.59 
 
 
437 aa  279  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  42 
 
 
428 aa  277  3e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.23 
 
 
426 aa  276  5e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0463  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.33 
 
 
422 aa  274  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0936737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>