More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3092 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
437 aa  887    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  60.05 
 
 
434 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.69767 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2965  dihydroorotase  62.2 
 
 
426 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.322465  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1870  dihydroorotase, multifunctional complex type  58.47 
 
 
420 aa  477  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1426  dihydroorotase, multifunctional complex type  60.62 
 
 
426 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0463  dihydroorotase, multifunctional complex type  61.81 
 
 
422 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0936737 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  47.83 
 
 
422 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.95 
 
 
425 aa  359  6e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.23 
 
 
424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  45.87 
 
 
425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.41 
 
 
425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.84 
 
 
427 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.38 
 
 
434 aa  349  6e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.89 
 
 
425 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.14 
 
 
424 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.83 
 
 
425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.42 
 
 
429 aa  342  8e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  43.17 
 
 
426 aa  339  5e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.65 
 
 
428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.6 
 
 
429 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  46 
 
 
434 aa  328  9e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.95 
 
 
436 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  40.92 
 
 
426 aa  327  3e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  46.49 
 
 
431 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.89 
 
 
441 aa  326  5e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.62 
 
 
429 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.16 
 
 
429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.09 
 
 
439 aa  316  5e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  44.79 
 
 
427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  42.15 
 
 
426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  42.79 
 
 
436 aa  310  4e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  44.9 
 
 
428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  44.82 
 
 
427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  43.41 
 
 
449 aa  306  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.59 
 
 
430 aa  306  6e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  41.28 
 
 
425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.69 
 
 
425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.66 
 
 
433 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.89 
 
 
442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.58 
 
 
434 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  42.51 
 
 
429 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  39.62 
 
 
425 aa  300  2e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  42.29 
 
 
430 aa  300  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  41.92 
 
 
431 aa  300  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.9 
 
 
432 aa  299  7e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  43.99 
 
 
442 aa  299  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  43.54 
 
 
432 aa  298  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.37 
 
 
448 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  42.15 
 
 
462 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  43.06 
 
 
431 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5244  dihydroorotase  43 
 
 
433 aa  296  6e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  43.06 
 
 
431 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  43.06 
 
 
431 aa  296  7e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  43.14 
 
 
430 aa  296  7e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  41.67 
 
 
431 aa  296  7e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.27 
 
 
437 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  39.74 
 
 
423 aa  294  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.32 
 
 
473 aa  294  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.07 
 
 
429 aa  293  6e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  42.32 
 
 
431 aa  292  8e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.74 
 
 
433 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  43.81 
 
 
435 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.56 
 
 
435 aa  291  1e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.15 
 
 
433 aa  290  3e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  44.44 
 
 
433 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.44 
 
 
433 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  45.55 
 
 
428 aa  288  1e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  43.56 
 
 
428 aa  288  2e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.2 
 
 
433 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.69 
 
 
437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  41.71 
 
 
432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  43.56 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  43.99 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.46 
 
 
488 aa  283  6.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  41.85 
 
 
431 aa  282  7.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.8 
 
 
430 aa  282  8.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  42.59 
 
 
432 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  41.98 
 
 
448 aa  281  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.41 
 
 
428 aa  280  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.61 
 
 
426 aa  280  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  42.59 
 
 
425 aa  279  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1324  dihydroorotase  39.4 
 
 
454 aa  278  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.198693 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.13 
 
 
430 aa  278  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  42.96 
 
 
425 aa  276  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2337  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.41 
 
 
436 aa  276  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  42.31 
 
 
458 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  42.79 
 
 
431 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1707  dihydroorotase  43.52 
 
 
451 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  39.45 
 
 
428 aa  272  9e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  43.41 
 
 
446 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  39.15 
 
 
442 aa  272  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.62 
 
 
428 aa  271  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  37.17 
 
 
428 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12610  dihydroorotase  41.36 
 
 
459 aa  271  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0812321  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.5 
 
 
431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  36.93 
 
 
428 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.15 
 
 
497 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  38.13 
 
 
428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  36.93 
 
 
428 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  38.24 
 
 
433 aa  266  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>