More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1830 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 428 aa  880    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.41 
 
 		 426 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  47.88 
 
 		 425 aa  416  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.88 
 
 		 431 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  47.52 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  49.29 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.99 
 
 		 423 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  47.52 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  46.67 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.18 
 
 		 458 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.39 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  47.26 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  47.26 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  46.54 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  46.1 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  44.94 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  47.02 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  47.97 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  43.74 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  47.17 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  46.78 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  44.87 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  44.24 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  42.03 
 
 		 431 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  42.03 
 
 		 431 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  42.26 
 
 		 431 aa  362  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0465  dihydroorotase  46.06 
 
 		 423 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  43.03 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  42.76 
 
 		 428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  42.79 
 
 		 425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  41.53 
 
 		 435 aa  348  8e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  41.36 
 
 		 428 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  42.49 
 
 		 425 aa  346  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  41.08 
 
 		 425 aa  345  6e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  42.33 
 
 		 431 aa  345  6e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  40.85 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  40.32 
 
 		 446 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  42.49 
 
 		 425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  42.49 
 
 		 425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  42.25 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  44.21 
 
 		 439 aa  343  5e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  40.61 
 
 		 425 aa  342  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  40.61 
 
 		 425 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  40.61 
 
 		 425 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  40.61 
 
 		 425 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  40.61 
 
 		 425 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  40.61 
 
 		 425 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  40.61 
 
 		 425 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  40.61 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  41.51 
 
 		 422 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  41.31 
 
 		 431 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  40.28 
 
 		 426 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  43.66 
 
 		 448 aa  334  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3760  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.65 
 
 		 437 aa  333  5e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  42.92 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  40.19 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  41.51 
 
 		 415 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.5 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  41.82 
 
 		 427 aa  326  6e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  41.63 
 
 		 441 aa  325  7e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.47 
 
 		 425 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  40.57 
 
 		 425 aa  323  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.44 
 
 		 424 aa  319  5e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.91 
 
 		 425 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  40.52 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.44 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.91 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  41.4 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  39.63 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  36.88 
 
 		 423 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  39.81 
 
 		 427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  38.32 
 
 		 431 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  38.23 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.48 
 
 		 434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  35.76 
 
 		 426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.95 
 
 		 433 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.24 
 
 		 439 aa  302  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  37.85 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  38.3 
 
 		 433 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  38.06 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  40.28 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.1 
 
 		 429 aa  297  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  36.98 
 
 		 431 aa  296  6e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  37.65 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.94 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.41 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.59 
 
 		 434 aa  294  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.25 
 
 		 442 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  37.18 
 
 		 433 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.75 
 
 		 488 aa  293  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.11 
 
 		 429 aa  293  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  37.18 
 
 		 436 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  38.41 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  38.16 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.12 
 
 		 434 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  35.61 
 
 		 426 aa  289  6e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.03 
 
 		 428 aa  289  6e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.95 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.98 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  37.44 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>