More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2739 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  82.03 
 
 		 425 aa  721    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  86.11 
 
 		 448 aa  739    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  100 
 
 		 439 aa  899    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  80.14 
 
 		 425 aa  714    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  80.38 
 
 		 425 aa  714    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  70.59 
 
 		 425 aa  616  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  69.25 
 
 		 426 aa  614  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  70.35 
 
 		 425 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  70.35 
 
 		 425 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  70.35 
 
 		 425 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  70.35 
 
 		 425 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  68.94 
 
 		 425 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  70.35 
 
 		 425 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  70.35 
 
 		 425 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  70.12 
 
 		 425 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  68.87 
 
 		 425 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  69.58 
 
 		 425 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  69.56 
 
 		 428 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  69.09 
 
 		 428 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  69.34 
 
 		 425 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  68.63 
 
 		 425 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  69.34 
 
 		 425 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  69.34 
 
 		 425 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  64.55 
 
 		 446 aa  571  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  64.19 
 
 		 431 aa  565  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  63.26 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  63.26 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  64.88 
 
 		 431 aa  550  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  61.95 
 
 		 431 aa  548  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  61.4 
 
 		 435 aa  543  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  64.6 
 
 		 441 aa  531  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  62.26 
 
 		 424 aa  526  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  62.56 
 
 		 424 aa  526  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  62.8 
 
 		 424 aa  525  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  63.51 
 
 		 439 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  62.68 
 
 		 427 aa  522  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  62.03 
 
 		 425 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  60.19 
 
 		 432 aa  501  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  54.61 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  48.1 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.52 
 
 		 426 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  49.04 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  45.84 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.39 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.86 
 
 		 458 aa  361  1e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.9 
 
 		 428 aa  360  3e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.52 
 
 		 431 aa  360  3e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  44.68 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  41.13 
 
 		 425 aa  336  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  44.92 
 
 		 423 aa  333  5e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  43.26 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  43.5 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  43.03 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.45 
 
 		 423 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.72 
 
 		 425 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  42.22 
 
 		 423 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  42.55 
 
 		 423 aa  326  6e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  44.21 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.53 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  40.19 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.86 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  38.55 
 
 		 427 aa  317  3e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  43.26 
 
 		 423 aa  315  9e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  39.34 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  38.23 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0465  dihydroorotase  43.03 
 
 		 423 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  38.81 
 
 		 422 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.41 
 
 		 425 aa  311  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  40.65 
 
 		 438 aa  310  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.77 
 
 		 425 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.1 
 
 		 430 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.21 
 
 		 425 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  38.79 
 
 		 432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.97 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.33 
 
 		 433 aa  300  4e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.71 
 
 		 434 aa  298  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  40.14 
 
 		 433 aa  297  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  41.37 
 
 		 428 aa  295  8e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.48 
 
 		 434 aa  295  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  40.43 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.72 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  40.19 
 
 		 428 aa  293  6e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  39.44 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.44 
 
 		 442 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.1 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.76 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.22 
 
 		 434 aa  290  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  38.55 
 
 		 429 aa  289  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.29 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  39.44 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  37.2 
 
 		 425 aa  287  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  38.26 
 
 		 433 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.23 
 
 		 429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  38.97 
 
 		 434 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.97 
 
 		 433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  39.2 
 
 		 436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3760  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.43 
 
 		 437 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  38.32 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.62 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  39.91 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>