More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0364 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  100 
 
 
429 aa  869    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  55.11 
 
 
431 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.55 
 
 
426 aa  455  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  50.24 
 
 
424 aa  425  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  48.58 
 
 
425 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  52.83 
 
 
423 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  47.63 
 
 
425 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  47.87 
 
 
425 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.31 
 
 
431 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  49.53 
 
 
424 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.52 
 
 
428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.69 
 
 
427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.36 
 
 
458 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  49.05 
 
 
423 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  49.29 
 
 
423 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  48.81 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  48.57 
 
 
423 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.7 
 
 
423 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  48.7 
 
 
423 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  48.81 
 
 
423 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  46.93 
 
 
425 aa  398  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  49.88 
 
 
426 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  49.52 
 
 
423 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  48.1 
 
 
439 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  46.12 
 
 
424 aa  388  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  45.69 
 
 
431 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  48.57 
 
 
423 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  45.26 
 
 
425 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  45.26 
 
 
425 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  45.26 
 
 
425 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  45.02 
 
 
425 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  45.26 
 
 
425 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  45.26 
 
 
425 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  45.26 
 
 
425 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  44.55 
 
 
425 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  45.26 
 
 
425 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  48.1 
 
 
448 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  46.21 
 
 
425 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  44.68 
 
 
426 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  46.45 
 
 
425 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0465  dihydroorotase  49.05 
 
 
423 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  44.94 
 
 
428 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  46.45 
 
 
425 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  46.57 
 
 
425 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  44.79 
 
 
425 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  44.63 
 
 
425 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  45.18 
 
 
428 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  45.22 
 
 
431 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  44.94 
 
 
435 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  44.79 
 
 
425 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  43.59 
 
 
431 aa  362  8e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  43.59 
 
 
431 aa  362  8e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  44.68 
 
 
431 aa  361  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  42.36 
 
 
446 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  43.9 
 
 
427 aa  350  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  44.83 
 
 
439 aa  350  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  45.71 
 
 
441 aa  350  4e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.98 
 
 
425 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.05 
 
 
424 aa  338  9e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  43.95 
 
 
432 aa  336  3.9999999999999995e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  43.63 
 
 
415 aa  335  5.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  39.95 
 
 
422 aa  333  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.34 
 
 
425 aa  332  5e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  39.44 
 
 
425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  40.47 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3760  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.62 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.9 
 
 
425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.53 
 
 
434 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  40 
 
 
436 aa  324  2e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.3 
 
 
425 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  41.23 
 
 
431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.24 
 
 
429 aa  318  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.86 
 
 
427 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.81 
 
 
433 aa  310  4e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.24 
 
 
429 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.35 
 
 
424 aa  307  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  38.92 
 
 
429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.05 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.05 
 
 
433 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  41.05 
 
 
433 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  39.44 
 
 
428 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.29 
 
 
434 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.73 
 
 
442 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  36.34 
 
 
431 aa  296  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  39.76 
 
 
433 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.01 
 
 
433 aa  296  7e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  38.79 
 
 
428 aa  295  8e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.24 
 
 
439 aa  295  9e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.85 
 
 
429 aa  293  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.81 
 
 
434 aa  293  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.24 
 
 
433 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  35.65 
 
 
426 aa  291  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.61 
 
 
488 aa  290  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  39.47 
 
 
427 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  38.57 
 
 
433 aa  290  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  39.01 
 
 
431 aa  287  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  38 
 
 
436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  37.62 
 
 
436 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  38.33 
 
 
433 aa  286  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  37.26 
 
 
428 aa  286  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>