More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0911 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  76.46 
 
 
435 aa  667    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  76.92 
 
 
446 aa  678    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  84.42 
 
 
431 aa  729    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  77.67 
 
 
431 aa  674    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  78.6 
 
 
431 aa  683    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  77.49 
 
 
432 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  84.42 
 
 
431 aa  729    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  100 
 
 
431 aa  857    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  77.14 
 
 
439 aa  628  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  74.88 
 
 
427 aa  618  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  72.98 
 
 
441 aa  601  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  69.37 
 
 
425 aa  585  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  69.14 
 
 
425 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  69.14 
 
 
425 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  69.14 
 
 
425 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  69.14 
 
 
425 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  69.14 
 
 
425 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  69.14 
 
 
425 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  68.91 
 
 
425 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  66.05 
 
 
425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  65.81 
 
 
425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  65.81 
 
 
425 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  65.66 
 
 
425 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  65.66 
 
 
426 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  67.28 
 
 
428 aa  559  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  66.36 
 
 
425 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  64.19 
 
 
439 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  66.36 
 
 
428 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  65.03 
 
 
425 aa  553  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  66.82 
 
 
425 aa  545  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  66.36 
 
 
425 aa  545  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  67.05 
 
 
425 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  67.05 
 
 
425 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  64.49 
 
 
448 aa  535  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  59.77 
 
 
425 aa  485  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  57.58 
 
 
424 aa  487  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  57.58 
 
 
424 aa  481  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  57.21 
 
 
424 aa  474  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  50.23 
 
 
415 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.74 
 
 
426 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  45.22 
 
 
429 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  47.53 
 
 
426 aa  365  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  45.33 
 
 
431 aa  350  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  45.12 
 
 
423 aa  348  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.76 
 
 
431 aa  342  8e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.35 
 
 
458 aa  340  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  45.58 
 
 
423 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.31 
 
 
428 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.55 
 
 
423 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.35 
 
 
427 aa  334  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  44.55 
 
 
423 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  45.12 
 
 
423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  44.19 
 
 
423 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  43.95 
 
 
423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  42.79 
 
 
423 aa  322  7e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  40.28 
 
 
425 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  42.56 
 
 
423 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  44.19 
 
 
423 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0465  dihydroorotase  43.26 
 
 
423 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.42 
 
 
433 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  40.23 
 
 
432 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.65 
 
 
434 aa  293  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.67 
 
 
425 aa  293  6e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  37.76 
 
 
422 aa  292  7e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.62 
 
 
430 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.3 
 
 
425 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.41 
 
 
434 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.74 
 
 
424 aa  290  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.75 
 
 
433 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.27 
 
 
434 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  38.37 
 
 
427 aa  287  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  40.69 
 
 
438 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  38.14 
 
 
436 aa  286  7e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.52 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  37.38 
 
 
428 aa  283  6.000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3760  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.56 
 
 
437 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  37.96 
 
 
428 aa  279  6e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.51 
 
 
425 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  36.36 
 
 
425 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.43 
 
 
425 aa  276  7e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  40.23 
 
 
428 aa  275  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  38.76 
 
 
433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.58 
 
 
429 aa  273  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.43 
 
 
424 aa  273  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  38.37 
 
 
428 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  38.37 
 
 
428 aa  272  7e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  38.25 
 
 
433 aa  271  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  38.11 
 
 
436 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  37.64 
 
 
433 aa  270  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.95 
 
 
430 aa  269  5.9999999999999995e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  35.73 
 
 
431 aa  268  2e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  37.18 
 
 
433 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.3 
 
 
433 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  37.32 
 
 
429 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  37.79 
 
 
434 aa  265  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 
433 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.49 
 
 
439 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  33.33 
 
 
431 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.53 
 
 
433 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  35.75 
 
 
431 aa  259  8e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>