More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0600 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  100 
 
 
428 aa  862    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  90.89 
 
 
428 aa  781    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  99.07 
 
 
428 aa  853    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  69.34 
 
 
431 aa  619  1e-176  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  72.37 
 
 
428 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  68.16 
 
 
429 aa  608  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  69.29 
 
 
434 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  67.61 
 
 
430 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  66.12 
 
 
430 aa  571  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  57.68 
 
 
433 aa  491  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  59.1 
 
 
433 aa  491  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  58.87 
 
 
433 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  59.81 
 
 
438 aa  488  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  58.39 
 
 
436 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  58.16 
 
 
433 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  58.16 
 
 
436 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  57.28 
 
 
433 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  57.68 
 
 
437 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  58.63 
 
 
433 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  58.71 
 
 
430 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  55.84 
 
 
434 aa  455  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.1 
 
 
434 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.47 
 
 
433 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.44 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.98 
 
 
446 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.51 
 
 
439 aa  404  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  48.94 
 
 
432 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.74 
 
 
423 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  46.15 
 
 
436 aa  365  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.95 
 
 
425 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  46.95 
 
 
425 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.86 
 
 
434 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.88 
 
 
424 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  46.5 
 
 
422 aa  351  1e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.73 
 
 
430 aa  341  1e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  47.02 
 
 
432 aa  340  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  40.94 
 
 
447 aa  330  4e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  41.65 
 
 
459 aa  329  6e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.06 
 
 
447 aa  320  3e-86  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.37 
 
 
424 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  39.44 
 
 
427 aa  312  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  39.2 
 
 
436 aa  310  4e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  39.48 
 
 
422 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.62 
 
 
425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.06 
 
 
424 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.79 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.59 
 
 
425 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  40.24 
 
 
428 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  39.9 
 
 
425 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  39.67 
 
 
425 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.92 
 
 
425 aa  294  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.24 
 
 
425 aa  293  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  39.67 
 
 
425 aa  292  7e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  40.43 
 
 
439 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  36.85 
 
 
425 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  37.03 
 
 
429 aa  290  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  38.8 
 
 
431 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  37.83 
 
 
425 aa  289  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  36.88 
 
 
426 aa  289  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.92 
 
 
429 aa  289  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.12 
 
 
430 aa  289  7e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.64 
 
 
434 aa  288  9e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.59 
 
 
428 aa  288  9e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  39.03 
 
 
435 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  38.34 
 
 
431 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  38.34 
 
 
431 aa  288  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  39.72 
 
 
428 aa  288  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  39.95 
 
 
425 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.48 
 
 
441 aa  286  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  37.7 
 
 
428 aa  286  5.999999999999999e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.35 
 
 
428 aa  285  9e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  42.55 
 
 
448 aa  285  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  39.72 
 
 
428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  39.01 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  37.83 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  39.01 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  39.01 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  39.01 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  39.01 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  39.01 
 
 
425 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.16 
 
 
433 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.3 
 
 
429 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  39.01 
 
 
425 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  38.77 
 
 
425 aa  280  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.53 
 
 
429 aa  279  8e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.93 
 
 
433 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.23 
 
 
427 aa  278  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.1 
 
 
430 aa  277  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  38.37 
 
 
431 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  38.66 
 
 
446 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  39.3 
 
 
431 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  37.06 
 
 
429 aa  276  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.74 
 
 
438 aa  275  9e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  40.38 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  36.71 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  37.74 
 
 
426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  39.67 
 
 
425 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  40.14 
 
 
425 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  40.14 
 
 
425 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  37.83 
 
 
424 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>