More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1003 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  100 
 
 		 425 aa  850    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  98.35 
 
 		 425 aa  837    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  96.21 
 
 		 424 aa  803    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  72.22 
 
 		 436 aa  621  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  73.16 
 
 		 423 aa  605  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  73.81 
 
 		 422 aa  596  1e-169  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  73.87 
 
 		 432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  51.3 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  50.59 
 
 		 433 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  50.35 
 
 		 433 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  50.12 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.65 
 
 		 434 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  50 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.17 
 
 		 434 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.24 
 
 		 433 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  49.41 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.12 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.46 
 
 		 434 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  50.59 
 
 		 437 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  49.17 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.06 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  50.24 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.48 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.67 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  44.92 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.75 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  45.75 
 
 		 429 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  46.95 
 
 		 428 aa  363  3e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  46.78 
 
 		 434 aa  362  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  47.18 
 
 		 428 aa  359  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  46.48 
 
 		 428 aa  358  9e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.73 
 
 		 433 aa  356  5e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  45 
 
 		 432 aa  352  1e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  48.24 
 
 		 430 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  45.54 
 
 		 430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  38.81 
 
 		 459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.04 
 
 		 430 aa  296  6e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  38.59 
 
 		 427 aa  292  8e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  35.7 
 
 		 447 aa  291  1e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  38.81 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.81 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.5 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  37.88 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  36.85 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.77 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0603  dihydroorotase  42.55 
 
 		 409 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.12 
 
 		 429 aa  277  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  37.68 
 
 		 425 aa  276  7e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.59 
 
 		 428 aa  276  7e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.5 
 
 		 424 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.14 
 
 		 423 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  36.47 
 
 		 428 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  37.44 
 
 		 425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  39.44 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0923  amidohydrolase  41.05 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.671663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.76 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  37.2 
 
 		 425 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  38.97 
 
 		 423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  36.73 
 
 		 431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  38.97 
 
 		 423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  38.73 
 
 		 423 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  37.26 
 
 		 422 aa  266  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  38.68 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.06 
 
 		 436 aa  264  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  34.29 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  36.49 
 
 		 425 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  36.49 
 
 		 425 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  36.49 
 
 		 425 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  36.49 
 
 		 425 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  36.49 
 
 		 425 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1714  dihydroorotase  38.48 
 
 		 425 aa  262  6.999999999999999e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.644473  normal  0.407815 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  36.49 
 
 		 425 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  36.49 
 
 		 425 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.9 
 
 		 425 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.85 
 
 		 426 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  39.62 
 
 		 423 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.59 
 
 		 441 aa  259  9e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  39.39 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  36.02 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.36 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.36 
 
 		 425 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.33 
 
 		 425 aa  257  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  36.47 
 
 		 428 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.36 
 
 		 425 aa  256  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  36.97 
 
 		 425 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  35.38 
 
 		 425 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  35.07 
 
 		 431 aa  256  7e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  36.97 
 
 		 439 aa  256  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  36.49 
 
 		 425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  36 
 
 		 428 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.28 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  36.97 
 
 		 425 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.03 
 
 		 431 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  34.74 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.12 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3062  dihydroorotase  39.05 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.82 
 
 		 435 aa  250  3e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  32.46 
 
 		 426 aa  251  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  37.68 
 
 		 448 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.66 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>