More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0732 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
428 aa  830    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  66.43 
 
 
430 aa  521  1e-147  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  49.28 
 
 
432 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.69 
 
 
433 aa  364  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.28 
 
 
433 aa  363  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.37 
 
 
433 aa  360  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.32 
 
 
434 aa  351  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.08 
 
 
434 aa  348  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.79 
 
 
434 aa  347  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.76 
 
 
425 aa  345  8e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  45.11 
 
 
428 aa  344  2e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.32 
 
 
430 aa  343  4e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  45.5 
 
 
436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  40.9 
 
 
431 aa  338  9.999999999999999e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  44.65 
 
 
433 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.76 
 
 
425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  46.32 
 
 
433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  40.81 
 
 
422 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  45.84 
 
 
433 aa  336  5e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  44.79 
 
 
436 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.23 
 
 
424 aa  335  9e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.96 
 
 
446 aa  335  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  43.71 
 
 
433 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.33 
 
 
424 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.86 
 
 
425 aa  328  8e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  44.37 
 
 
438 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  43.84 
 
 
437 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  43.74 
 
 
428 aa  321  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  41.71 
 
 
429 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  42.79 
 
 
428 aa  320  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  38.9 
 
 
426 aa  319  5e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  42.55 
 
 
428 aa  315  8e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.94 
 
 
442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.6 
 
 
429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.44 
 
 
423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.96 
 
 
434 aa  311  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.7 
 
 
439 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.81 
 
 
425 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.82 
 
 
428 aa  310  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.34 
 
 
436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.62 
 
 
429 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.71 
 
 
433 aa  303  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  42.45 
 
 
430 aa  302  8.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.23 
 
 
433 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  41.39 
 
 
434 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.77 
 
 
425 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  41.94 
 
 
428 aa  299  5e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.47 
 
 
433 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  41.77 
 
 
425 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  41.87 
 
 
424 aa  297  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3062  dihydroorotase  44.68 
 
 
409 aa  297  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  40.87 
 
 
425 aa  296  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  41.88 
 
 
431 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  43.23 
 
 
433 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  41.67 
 
 
422 aa  293  3e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.67 
 
 
424 aa  293  4e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0923  amidohydrolase  45.52 
 
 
407 aa  292  6e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.671663  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.86 
 
 
439 aa  292  7e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  42.79 
 
 
432 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  41.47 
 
 
430 aa  292  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  39.76 
 
 
425 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  39.28 
 
 
425 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.38 
 
 
429 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  37.47 
 
 
459 aa  290  4e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  41.11 
 
 
448 aa  290  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  40.48 
 
 
425 aa  290  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  40.72 
 
 
425 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  40.72 
 
 
425 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  40.72 
 
 
425 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  40.72 
 
 
425 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  40.7 
 
 
436 aa  289  6e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  40.72 
 
 
425 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  40.72 
 
 
425 aa  289  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  39.95 
 
 
439 aa  289  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  39.28 
 
 
425 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  40.72 
 
 
425 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  36.52 
 
 
427 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  39.1 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  40.72 
 
 
425 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.08 
 
 
429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0603  dihydroorotase  47.34 
 
 
409 aa  282  7.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  35.97 
 
 
431 aa  282  9e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.14 
 
 
435 aa  281  1e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  35.56 
 
 
436 aa  281  1e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  39.04 
 
 
425 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  40.67 
 
 
428 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  38.55 
 
 
424 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.2 
 
 
428 aa  278  1e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.44 
 
 
425 aa  278  2e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.43 
 
 
434 aa  277  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  37.05 
 
 
431 aa  276  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.05 
 
 
448 aa  276  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  34.44 
 
 
447 aa  276  6e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  40.33 
 
 
428 aa  275  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  40.96 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  40.96 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.49 
 
 
430 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  41.2 
 
 
425 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.15 
 
 
447 aa  272  1e-71  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  39.58 
 
 
427 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>