More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3191 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  100 
 
 		 432 aa  867    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.66 
 
 		 433 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  55.16 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.78 
 
 		 433 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.68 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.44 
 
 		 434 aa  421  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.83 
 
 		 430 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  54.29 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  50.12 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.76 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  49.65 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  49.41 
 
 		 433 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  50.6 
 
 		 436 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  49.16 
 
 		 433 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  50.36 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  48.94 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  49.88 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  48.94 
 
 		 428 aa  391  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  49.76 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  47.8 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.67 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  42.39 
 
 		 447 aa  376  1e-103  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.53 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  48.93 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  46.01 
 
 		 431 aa  377  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.39 
 
 		 447 aa  374  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.78 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  42.55 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  45.93 
 
 		 429 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.59 
 
 		 438 aa  359  7e-98  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  46.75 
 
 		 434 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  46.48 
 
 		 430 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  46.75 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.08 
 
 		 424 aa  349  4e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.3 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  45.02 
 
 		 425 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.08 
 
 		 428 aa  346  5e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  48.48 
 
 		 432 aa  345  8.999999999999999e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.3 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  45.97 
 
 		 430 aa  342  7e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.78 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.93 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  43.13 
 
 		 422 aa  342  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  45 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  43.06 
 
 		 436 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.37 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  42.82 
 
 		 427 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.76 
 
 		 425 aa  336  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.3 
 
 		 425 aa  335  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  43.69 
 
 		 436 aa  335  9e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  45.58 
 
 		 422 aa  334  2e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  42.6 
 
 		 431 aa  332  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.27 
 
 		 425 aa  330  4e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  41.2 
 
 		 426 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.14 
 
 		 429 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.25 
 
 		 428 aa  319  5e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.68 
 
 		 429 aa  318  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.23 
 
 		 429 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  40.71 
 
 		 428 aa  316  4e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.83 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.88 
 
 		 442 aa  313  4.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.94 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  41.59 
 
 		 431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.89 
 
 		 439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.71 
 
 		 441 aa  305  9.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  41.83 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.95 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.22 
 
 		 430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  41.23 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.2 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  42.04 
 
 		 423 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  40.91 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  40.91 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.34 
 
 		 429 aa  299  6e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.38 
 
 		 434 aa  299  8e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.04 
 
 		 423 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.35 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  41.73 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.51 
 
 		 433 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  40 
 
 		 431 aa  296  4e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  40.23 
 
 		 431 aa  296  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  40.75 
 
 		 446 aa  296  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  41.73 
 
 		 425 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  41.05 
 
 		 425 aa  296  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  39.53 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  40.47 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.19 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  42.17 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  40.47 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  41.83 
 
 		 425 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  41.83 
 
 		 425 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  41.83 
 
 		 425 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  39.62 
 
 		 424 aa  295  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  41.83 
 
 		 425 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  41.83 
 
 		 425 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  41.83 
 
 		 425 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  41.83 
 
 		 425 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  40.43 
 
 		 431 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  41.18 
 
 		 423 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  41.18 
 
 		 423 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>