More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3636 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  98.85 
 
 		 434 aa  847    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  95.13 
 
 		 433 aa  797    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  86.36 
 
 		 430 aa  688    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  86.05 
 
 		 433 aa  708    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  85.02 
 
 		 434 aa  692    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 434 aa  858    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  65.17 
 
 		 433 aa  543  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  64.07 
 
 		 436 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  63.74 
 
 		 433 aa  528  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  62.56 
 
 		 433 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  62.17 
 
 		 436 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  63.59 
 
 		 437 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  62.41 
 
 		 433 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  60.99 
 
 		 446 aa  490  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  60.28 
 
 		 438 aa  488  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  60.09 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  58.92 
 
 		 439 aa  476  1e-133  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  57.31 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  58.41 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  55.84 
 
 		 428 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  55.84 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  55.74 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  56.44 
 
 		 434 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  53.43 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  57.41 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  56.6 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  54.68 
 
 		 432 aa  431  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  52 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  51.42 
 
 		 422 aa  398  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.88 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  50.46 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  49.17 
 
 		 425 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.17 
 
 		 425 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.82 
 
 		 424 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  51.06 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.66 
 
 		 430 aa  360  3e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  45.52 
 
 		 428 aa  349  7e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.29 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.32 
 
 		 428 aa  340  4e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  40.9 
 
 		 422 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.75 
 
 		 425 aa  330  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.37 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.27 
 
 		 424 aa  329  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  45.52 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.86 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  45.52 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  45.52 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  45.52 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  45.52 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  45.52 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  41.08 
 
 		 427 aa  322  6e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  45.28 
 
 		 425 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.76 
 
 		 425 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  43.6 
 
 		 425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  45.04 
 
 		 425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.38 
 
 		 434 aa  319  5e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.69 
 
 		 429 aa  319  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  43.13 
 
 		 425 aa  319  7e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  45.65 
 
 		 428 aa  318  9e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  40.43 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  45.28 
 
 		 425 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  42.89 
 
 		 425 aa  316  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  39.91 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  38.48 
 
 		 447 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  42.37 
 
 		 425 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  39.67 
 
 		 431 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  46 
 
 		 425 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.63 
 
 		 429 aa  312  9e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  39.39 
 
 		 459 aa  312  1e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  45.76 
 
 		 425 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  45.76 
 
 		 425 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.76 
 
 		 447 aa  309  6.999999999999999e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.85 
 
 		 441 aa  309  8e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.67 
 
 		 438 aa  308  9e-83  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.45 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.47 
 
 		 434 aa  307  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  41.45 
 
 		 431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  44.2 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  41.45 
 
 		 431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  39.29 
 
 		 429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  38.68 
 
 		 426 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.69 
 
 		 442 aa  305  9.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  41.53 
 
 		 446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0923  amidohydrolase  43.2 
 
 		 407 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.671663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.59 
 
 		 428 aa  303  5.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  44.79 
 
 		 425 aa  302  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  42.15 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  41.65 
 
 		 431 aa  300  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.09 
 
 		 429 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.67 
 
 		 429 aa  300  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  41.23 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.35 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  42.62 
 
 		 448 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  40.71 
 
 		 439 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.92 
 
 		 433 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  40.28 
 
 		 431 aa  296  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  41.69 
 
 		 431 aa  295  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  42.22 
 
 		 433 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  41.79 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  41.79 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.762584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>