More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1283 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  100 
 
 
431 aa  876    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.64 
 
 
429 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  55.71 
 
 
431 aa  478  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.64 
 
 
425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  52.97 
 
 
426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.4 
 
 
427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.92 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.94 
 
 
425 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  51.66 
 
 
422 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.41 
 
 
428 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.59 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.71 
 
 
424 aa  435  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.47 
 
 
425 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  50.24 
 
 
425 aa  428  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.53 
 
 
425 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.58 
 
 
424 aa  425  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  53.4 
 
 
433 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.52 
 
 
429 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  51.18 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  50.72 
 
 
431 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  50.95 
 
 
436 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  50.82 
 
 
433 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  51.29 
 
 
433 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.35 
 
 
430 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.82 
 
 
433 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  49.77 
 
 
428 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.28 
 
 
434 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.26 
 
 
441 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.74 
 
 
497 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  46.57 
 
 
428 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.53 
 
 
497 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  46.57 
 
 
428 aa  388  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  46.34 
 
 
428 aa  388  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  46.34 
 
 
428 aa  388  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  46.34 
 
 
428 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  46.34 
 
 
428 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  46.34 
 
 
428 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  46.34 
 
 
428 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  46.34 
 
 
428 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.73 
 
 
431 aa  388  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.63 
 
 
425 aa  385  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  46.34 
 
 
428 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.21 
 
 
430 aa  385  1e-106  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  45.86 
 
 
428 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.87 
 
 
442 aa  388  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.84 
 
 
430 aa  384  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.64 
 
 
434 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.44 
 
 
448 aa  379  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.35 
 
 
429 aa  375  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  47.2 
 
 
427 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.69 
 
 
488 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.88 
 
 
432 aa  371  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.54 
 
 
430 aa  371  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.77 
 
 
473 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  43.59 
 
 
426 aa  369  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.86 
 
 
439 aa  371  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  48.3 
 
 
428 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.19 
 
 
429 aa  363  4e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  42.89 
 
 
425 aa  359  4e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  44.31 
 
 
425 aa  358  9.999999999999999e-98  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.72 
 
 
435 aa  358  9.999999999999999e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  43.36 
 
 
425 aa  357  2.9999999999999997e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  45.07 
 
 
423 aa  355  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  42.65 
 
 
426 aa  355  1e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  44.69 
 
 
430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.63 
 
 
426 aa  351  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.6 
 
 
425 aa  351  1e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  44.98 
 
 
462 aa  352  1e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  44.55 
 
 
427 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  43.31 
 
 
431 aa  349  6e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  43.52 
 
 
431 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  43.52 
 
 
431 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  43.29 
 
 
431 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  43.47 
 
 
428 aa  342  5.999999999999999e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.32 
 
 
429 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  44.66 
 
 
442 aa  341  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  43.29 
 
 
431 aa  340  4e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  42.63 
 
 
430 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12610  dihydroorotase  42.01 
 
 
459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0812321  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.69 
 
 
437 aa  335  5.999999999999999e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  43.44 
 
 
429 aa  335  5.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  42.73 
 
 
446 aa  335  1e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  45.04 
 
 
432 aa  333  2e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  44.42 
 
 
430 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  43 
 
 
449 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.55 
 
 
433 aa  333  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  44.21 
 
 
425 aa  332  6e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  42.56 
 
 
432 aa  332  6e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  44.21 
 
 
425 aa  332  6e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2337  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.95 
 
 
436 aa  331  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5244  dihydroorotase  41.2 
 
 
433 aa  330  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.02 
 
 
428 aa  328  8e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  43.76 
 
 
433 aa  328  9e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  44.2 
 
 
425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.41 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  42.86 
 
 
448 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  42.26 
 
 
435 aa  326  5e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.84 
 
 
437 aa  325  8.000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  43.99 
 
 
432 aa  325  8.000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  42.51 
 
 
425 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>