More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0952 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  100 
 
 
426 aa  868    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  70.42 
 
 
428 aa  637    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  60.19 
 
 
425 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  59.76 
 
 
425 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  58.35 
 
 
429 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  59.57 
 
 
422 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  59 
 
 
424 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  58.29 
 
 
425 aa  509  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.5 
 
 
424 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  57.38 
 
 
425 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  56.24 
 
 
427 aa  482  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  53.44 
 
 
425 aa  479  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  55.5 
 
 
431 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.87 
 
 
429 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  52.97 
 
 
431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.57 
 
 
430 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.81 
 
 
441 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.76 
 
 
436 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  52.02 
 
 
431 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.13 
 
 
439 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.53 
 
 
434 aa  428  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  49.06 
 
 
436 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  49.06 
 
 
427 aa  410  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.95 
 
 
442 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.94 
 
 
433 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.37 
 
 
430 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.82 
 
 
432 aa  400  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.11 
 
 
434 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  50 
 
 
428 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.93 
 
 
429 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  46.57 
 
 
423 aa  387  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.76 
 
 
433 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.09 
 
 
431 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.53 
 
 
433 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  47.76 
 
 
433 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.6 
 
 
430 aa  385  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.86 
 
 
435 aa  384  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.05 
 
 
429 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  47.17 
 
 
428 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.78 
 
 
425 aa  375  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.61 
 
 
426 aa  375  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.88 
 
 
434 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.03 
 
 
425 aa  374  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  45.97 
 
 
428 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  45.95 
 
 
428 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  45.95 
 
 
428 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  45.95 
 
 
428 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  45.7 
 
 
428 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  45.7 
 
 
428 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  45.7 
 
 
428 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  48.39 
 
 
425 aa  368  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.65 
 
 
430 aa  367  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  45.7 
 
 
428 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  46.19 
 
 
426 aa  366  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  46.08 
 
 
426 aa  367  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  45.95 
 
 
428 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  44.07 
 
 
427 aa  364  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  45.21 
 
 
428 aa  363  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  44.39 
 
 
428 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  45.21 
 
 
428 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  47.3 
 
 
425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  43.26 
 
 
429 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  43.72 
 
 
446 aa  348  8e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.41 
 
 
438 aa  347  3e-94  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  43.39 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  42.25 
 
 
430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.95 
 
 
429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  42.01 
 
 
430 aa  342  5.999999999999999e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.73 
 
 
448 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.17 
 
 
437 aa  339  5e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3185  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.04 
 
 
419 aa  338  8e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  42.58 
 
 
447 aa  338  9.999999999999999e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.17 
 
 
433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0816  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.28 
 
 
424 aa  336  5e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.58 
 
 
497 aa  336  5e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.51 
 
 
497 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.28 
 
 
433 aa  334  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  42.15 
 
 
446 aa  334  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  44.24 
 
 
425 aa  333  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.12 
 
 
447 aa  333  3e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  44.24 
 
 
425 aa  333  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  42.16 
 
 
425 aa  333  3e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  42.68 
 
 
432 aa  333  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  41.31 
 
 
428 aa  333  4e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  42.34 
 
 
432 aa  333  4e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  41.81 
 
 
459 aa  333  5e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1870  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.08 
 
 
420 aa  333  5e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  41.92 
 
 
425 aa  332  7.000000000000001e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  42.58 
 
 
431 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.91 
 
 
473 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.36 
 
 
437 aa  331  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  40.75 
 
 
449 aa  328  8e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  41.93 
 
 
433 aa  328  8e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  40.19 
 
 
423 aa  328  9e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1324  dihydroorotase  42.82 
 
 
454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.198693 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  40.95 
 
 
448 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  38.83 
 
 
431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2965  dihydroorotase  44.36 
 
 
426 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.322465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3201  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.6 
 
 
447 aa  326  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  41.2 
 
 
432 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>