More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3185 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3185  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 419 aa  850    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.44 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  42.04 
 
 		 426 aa  338  8e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.84 
 
 		 425 aa  338  9e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.37 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6624  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.13 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1793  dihydroorotase  38.8 
 
 		 421 aa  330  4e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.823522  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.98 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.78 
 
 		 424 aa  326  6e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3119  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.62 
 
 		 419 aa  324  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317311  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4467  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.19 
 
 		 427 aa  323  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.400386 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.51 
 
 		 425 aa  319  7e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.88 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.24 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2449  amidohydrolase  41.58 
 
 		 416 aa  313  4.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08046  Dihydroorotase  40.64 
 
 		 439 aa  311  9e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.156955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  38.48 
 
 		 422 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.33 
 
 		 436 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.04 
 
 		 434 aa  299  5e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.8 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.88 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  36.59 
 
 		 425 aa  292  6e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.65 
 
 		 430 aa  288  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.13 
 
 		 430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0093  dihydroorotase  37.59 
 
 		 418 aa  283  5.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  36.65 
 
 		 431 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.68 
 
 		 434 aa  280  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  36.65 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.53 
 
 		 430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.01 
 
 		 425 aa  272  9e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.45 
 
 		 430 aa  271  1e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.79 
 
 		 439 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  35.58 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  35.61 
 
 		 426 aa  269  8e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.29 
 
 		 432 aa  268  1e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.14 
 
 		 435 aa  266  2.9999999999999995e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.39 
 
 		 425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  35.58 
 
 		 427 aa  266  7e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  36.59 
 
 		 426 aa  265  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  36.65 
 
 		 425 aa  264  3e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  35.77 
 
 		 431 aa  263  6e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  38.52 
 
 		 428 aa  263  6e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  35.77 
 
 		 428 aa  261  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  34.95 
 
 		 432 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.11 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  36.53 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.02 
 
 		 448 aa  257  3e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  35.44 
 
 		 425 aa  256  4e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.27 
 
 		 429 aa  256  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.31 
 
 		 441 aa  256  6e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  36.43 
 
 		 446 aa  256  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.59 
 
 		 433 aa  256  8e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.85 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  35.11 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.55 
 
 		 429 aa  253  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  35.51 
 
 		 423 aa  250  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  37.47 
 
 		 431 aa  249  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  33.17 
 
 		 429 aa  249  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  37.17 
 
 		 442 aa  248  1e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  35.32 
 
 		 423 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.7 
 
 		 488 aa  246  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.09 
 
 		 442 aa  245  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  34.1 
 
 		 440 aa  246  8e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2435  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.76 
 
 		 497 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  0.142653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  34.84 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.12 
 
 		 428 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  37 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  37.37 
 
 		 433 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  34.44 
 
 		 449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.61 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.03 
 
 		 473 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  32.94 
 
 		 423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.94 
 
 		 429 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  33.17 
 
 		 423 aa  243  3e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3760  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.03 
 
 		 437 aa  244  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  36.29 
 
 		 458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12610  dihydroorotase  35.24 
 
 		 459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0812321  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1262  dihydroorotase  35.64 
 
 		 440 aa  243  5e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.98 
 
 		 433 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  33.89 
 
 		 423 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0898  dihydroorotase  32.88 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  33.89 
 
 		 423 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2862  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.97 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.816454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.74 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.23 
 
 		 433 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  34.23 
 
 		 432 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.73 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.59 
 
 		 437 aa  240  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1091  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.38 
 
 		 429 aa  239  5e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000303953  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1038  dihydroorotase  34.72 
 
 		 440 aa  239  5.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.933737  hitchhiker  0.00310904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  33.41 
 
 		 436 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  35.27 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1707  dihydroorotase  35 
 
 		 451 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.79 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  35.79 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1324  dihydroorotase  35.63 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.198693 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  33.5 
 
 		 433 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.41 
 
 		 434 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.9 
 
 		 433 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.24 
 
 		 433 aa  236  7e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>