More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4467 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4467  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 427 aa  870    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.400386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6624  dihydroorotase, multifunctional complex type  60.84 
 
 		 434 aa  520  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1793  dihydroorotase  44.86 
 
 		 421 aa  383  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.823522  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3119  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.96 
 
 		 419 aa  364  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317311  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.66 
 
 		 434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3185  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.19 
 
 		 419 aa  323  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.76 
 
 		 430 aa  309  5.9999999999999995e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.23 
 
 		 429 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.39 
 
 		 425 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08046  Dihydroorotase  38.92 
 
 		 439 aa  301  1e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.156955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2449  amidohydrolase  41.46 
 
 		 416 aa  301  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.69 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.49 
 
 		 425 aa  296  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.72 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.53 
 
 		 425 aa  292  8e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.44 
 
 		 436 aa  292  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.23 
 
 		 424 aa  290  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0093  dihydroorotase  39.9 
 
 		 418 aa  290  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.33 
 
 		 429 aa  289  5.0000000000000004e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  38.41 
 
 		 422 aa  289  7e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.66 
 
 		 427 aa  288  9e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  38.08 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.57 
 
 		 425 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  37.64 
 
 		 431 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  38.67 
 
 		 427 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.6 
 
 		 430 aa  282  6.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.08 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  37.56 
 
 		 426 aa  280  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  38.16 
 
 		 436 aa  280  5e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  36.1 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.76 
 
 		 433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.38 
 
 		 441 aa  273  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.18 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.44 
 
 		 430 aa  271  1e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  38.67 
 
 		 431 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  38.22 
 
 		 428 aa  263  6e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0898  dihydroorotase  39.64 
 
 		 442 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  36.83 
 
 		 433 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.67 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.09 
 
 		 434 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  37 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.36 
 
 		 433 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.13 
 
 		 433 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.43 
 
 		 430 aa  256  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  36.88 
 
 		 446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.1 
 
 		 442 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1038  dihydroorotase  34.02 
 
 		 440 aa  253  6e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.933737  hitchhiker  0.00310904 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1091  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.7 
 
 		 429 aa  253  6e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000303953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  37.28 
 
 		 442 aa  252  7e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.12 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.24 
 
 		 432 aa  252  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  35.17 
 
 		 423 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  37.05 
 
 		 426 aa  250  4e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.29 
 
 		 431 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  35.2 
 
 		 425 aa  248  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  33.95 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  33.57 
 
 		 426 aa  248  2e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.17 
 
 		 423 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.51 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1262  dihydroorotase  36.76 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  37.77 
 
 		 428 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  35.43 
 
 		 425 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  35.43 
 
 		 425 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  35.43 
 
 		 425 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  37.26 
 
 		 432 aa  247  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  35.43 
 
 		 425 aa  247  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  35.43 
 
 		 425 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  35.43 
 
 		 425 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  34.89 
 
 		 423 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  37.53 
 
 		 428 aa  246  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  35.43 
 
 		 425 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  37.53 
 
 		 428 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  34.67 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  37.53 
 
 		 428 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.8 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.02 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0755  dihydroorotase multifunctional complex type  37.38 
 
 		 439 aa  244  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  37.07 
 
 		 428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  37.29 
 
 		 428 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  36.32 
 
 		 431 aa  243  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  37.07 
 
 		 428 aa  243  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  37.29 
 
 		 428 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  37.29 
 
 		 428 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  34.7 
 
 		 425 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.87 
 
 		 430 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  35.1 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  37.32 
 
 		 428 aa  242  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1877  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.62 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  35.28 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  34.64 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.48 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  34.87 
 
 		 436 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  36.83 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  34.42 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  38.29 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  34.66 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  33.33 
 
 		 440 aa  240  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  34.87 
 
 		 433 aa  239  5e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.28 
 
 		 428 aa  239  5.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  33.87 
 
 		 425 aa  239  8e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>