More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1793 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1793  dihydroorotase  100 
 
 
421 aa  864    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.823522  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6624  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.45 
 
 
434 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4467  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.86 
 
 
427 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.400386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3119  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.51 
 
 
419 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317311  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.81 
 
 
434 aa  348  8e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3185  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.8 
 
 
419 aa  330  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  40.57 
 
 
426 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.74 
 
 
424 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.4 
 
 
427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.72 
 
 
425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2449  amidohydrolase  40.79 
 
 
416 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.77 
 
 
424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  38 
 
 
425 aa  306  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08046  Dihydroorotase  39.32 
 
 
439 aa  305  7e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.156955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.42 
 
 
429 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  38.06 
 
 
422 aa  302  9e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0093  dihydroorotase  40.48 
 
 
418 aa  300  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  37.62 
 
 
427 aa  300  4e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.21 
 
 
425 aa  299  5e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  37.62 
 
 
436 aa  297  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  39 
 
 
431 aa  296  3e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.98 
 
 
436 aa  296  6e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.96 
 
 
441 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.92 
 
 
428 aa  292  8e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.26 
 
 
425 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.35 
 
 
429 aa  289  7e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.18 
 
 
425 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  35.61 
 
 
432 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  37.44 
 
 
426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  37.77 
 
 
431 aa  282  9e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.67 
 
 
430 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  36.32 
 
 
426 aa  281  1e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.17 
 
 
433 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  36.17 
 
 
433 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.93 
 
 
433 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.96 
 
 
430 aa  279  7e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  37.18 
 
 
428 aa  279  7e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.59 
 
 
432 aa  277  2e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.98 
 
 
434 aa  277  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.6 
 
 
439 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.58 
 
 
433 aa  276  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  35.95 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  33.89 
 
 
431 aa  273  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  36.92 
 
 
428 aa  273  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.12 
 
 
431 aa  272  8.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.75 
 
 
433 aa  272  9e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.27 
 
 
430 aa  270  4e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.82 
 
 
430 aa  270  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  37.2 
 
 
425 aa  269  5e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.02 
 
 
425 aa  269  7e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  36.66 
 
 
446 aa  268  8.999999999999999e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0898  dihydroorotase  37.18 
 
 
442 aa  267  2e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  34.59 
 
 
433 aa  268  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.57 
 
 
434 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.96 
 
 
442 aa  266  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  35.14 
 
 
429 aa  266  4e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  35.64 
 
 
425 aa  264  2e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  33.73 
 
 
433 aa  264  3e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  34.91 
 
 
425 aa  263  6e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  33.64 
 
 
429 aa  262  8e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 
430 aa  261  1e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  35.94 
 
 
425 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1262  dihydroorotase  34.69 
 
 
440 aa  261  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  34.55 
 
 
442 aa  261  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  35.94 
 
 
425 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  34.33 
 
 
425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1013  dihydroorotase  36.24 
 
 
449 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0448021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  33.49 
 
 
433 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  33.73 
 
 
436 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  33.49 
 
 
433 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1038  dihydroorotase  33.33 
 
 
440 aa  257  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.933737  hitchhiker  0.00310904 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  32.46 
 
 
425 aa  257  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  33.73 
 
 
436 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.86 
 
 
435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.51 
 
 
429 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  34.19 
 
 
428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  33.73 
 
 
437 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.57 
 
 
433 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.68 
 
 
429 aa  253  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.69 
 
 
473 aa  252  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  33.96 
 
 
428 aa  252  9.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  33.66 
 
 
424 aa  252  9.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.26 
 
 
434 aa  252  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  34.34 
 
 
427 aa  252  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  31.91 
 
 
425 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  31.91 
 
 
425 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  31.91 
 
 
425 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  31.91 
 
 
425 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  31.91 
 
 
425 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  31.91 
 
 
425 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  33.03 
 
 
440 aa  250  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1091  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.56 
 
 
429 aa  250  3e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000303953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  31.91 
 
 
425 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  35.45 
 
 
438 aa  249  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  34.28 
 
 
434 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.02 
 
 
434 aa  249  9e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  31.91 
 
 
425 aa  249  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  33.83 
 
 
428 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.86 
 
 
433 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.86 
 
 
448 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>