More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3119 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3119  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
419 aa  862    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317311  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1793  dihydroorotase  42.51 
 
 
421 aa  365  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.823522  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4467  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.96 
 
 
427 aa  364  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.400386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6624  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.76 
 
 
434 aa  354  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2449  amidohydrolase  44.11 
 
 
416 aa  341  1e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.39 
 
 
425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 
424 aa  333  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.24 
 
 
424 aa  332  6e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.76 
 
 
425 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.39 
 
 
425 aa  332  8e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.52 
 
 
425 aa  331  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.36 
 
 
434 aa  331  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  39.95 
 
 
422 aa  328  9e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0093  dihydroorotase  42.23 
 
 
418 aa  328  2.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3185  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.62 
 
 
419 aa  324  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.49 
 
 
428 aa  316  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  39.23 
 
 
426 aa  316  5e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.62 
 
 
434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08046  Dihydroorotase  39.81 
 
 
439 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.156955  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.09 
 
 
427 aa  308  9e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.76 
 
 
430 aa  300  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  36.92 
 
 
431 aa  296  5e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  38.85 
 
 
431 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.05 
 
 
429 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  37.29 
 
 
425 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.23 
 
 
430 aa  293  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.97 
 
 
436 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.89 
 
 
441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.62 
 
 
429 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.87 
 
 
432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  37.47 
 
 
427 aa  282  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.08 
 
 
425 aa  281  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.68 
 
 
442 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.5 
 
 
430 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  36.99 
 
 
436 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  38.2 
 
 
423 aa  278  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  40.63 
 
 
425 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  36.5 
 
 
428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  37.77 
 
 
425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  40.63 
 
 
425 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.17 
 
 
429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  36.36 
 
 
433 aa  272  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.36 
 
 
433 aa  272  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  38.95 
 
 
431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.53 
 
 
434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.58 
 
 
425 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.12 
 
 
433 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.37 
 
 
433 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.17 
 
 
439 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  40.7 
 
 
432 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  35.71 
 
 
426 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.62 
 
 
430 aa  265  1e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  36.74 
 
 
427 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  38.29 
 
 
430 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  37.53 
 
 
428 aa  263  4e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.95 
 
 
429 aa  263  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.37 
 
 
433 aa  262  6.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.05 
 
 
435 aa  261  1e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3201  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.52 
 
 
447 aa  260  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.56 
 
 
431 aa  260  4e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  39.11 
 
 
446 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  40.3 
 
 
428 aa  258  9e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  35.59 
 
 
425 aa  256  5e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  38.26 
 
 
431 aa  256  7e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  37.38 
 
 
427 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.48 
 
 
473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  35.68 
 
 
426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.52 
 
 
433 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.96 
 
 
448 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  38.07 
 
 
458 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  37.77 
 
 
428 aa  252  1e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15560  dihydroorotase  36.36 
 
 
431 aa  251  2e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  37.77 
 
 
428 aa  251  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.62 
 
 
428 aa  251  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1262  dihydroorotase  37.86 
 
 
440 aa  250  3e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  37.07 
 
 
431 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.14 
 
 
428 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  38.18 
 
 
435 aa  250  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  37.07 
 
 
431 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  34.52 
 
 
446 aa  250  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  37.07 
 
 
431 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.34 
 
 
437 aa  250  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  34.68 
 
 
433 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  33.49 
 
 
433 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  38.37 
 
 
462 aa  249  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  37.35 
 
 
430 aa  249  6e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.88 
 
 
437 aa  249  7e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  33.97 
 
 
436 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  34.5 
 
 
428 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  34.68 
 
 
436 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0816  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.68 
 
 
424 aa  248  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  34.5 
 
 
428 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  34.5 
 
 
428 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  34.5 
 
 
428 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  37.99 
 
 
449 aa  246  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  38.08 
 
 
433 aa  246  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  35.05 
 
 
428 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  32.94 
 
 
429 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1707  dihydroorotase  36.09 
 
 
451 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0209676 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  34.5 
 
 
428 aa  246  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>