More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08046 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08046  Dihydroorotase  100 
 
 
439 aa  895    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.156955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2449  amidohydrolase  58.81 
 
 
416 aa  479  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0093  dihydroorotase  54.44 
 
 
418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6624  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.51 
 
 
434 aa  322  7e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3185  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.64 
 
 
419 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3119  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.81 
 
 
419 aa  311  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317311  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1793  dihydroorotase  39.32 
 
 
421 aa  305  8.000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.823522  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4467  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.92 
 
 
427 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.400386 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.69 
 
 
434 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.25 
 
 
430 aa  267  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.25 
 
 
430 aa  266  5e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.59 
 
 
430 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.5 
 
 
427 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.73 
 
 
436 aa  258  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.57 
 
 
425 aa  256  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.78 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.12 
 
 
435 aa  250  3e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  35.53 
 
 
436 aa  251  3e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  35.61 
 
 
427 aa  250  4e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  33.1 
 
 
422 aa  249  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.01 
 
 
425 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.81 
 
 
434 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.25 
 
 
424 aa  247  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.73 
 
 
425 aa  247  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 
429 aa  246  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  34.44 
 
 
431 aa  246  8e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  36.01 
 
 
431 aa  243  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.75 
 
 
424 aa  243  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  32.68 
 
 
431 aa  242  7.999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.19 
 
 
428 aa  242  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  34.2 
 
 
426 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.04 
 
 
425 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.94 
 
 
425 aa  236  8e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.24 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.43 
 
 
430 aa  234  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  32.62 
 
 
431 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.63 
 
 
433 aa  232  9e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.09 
 
 
434 aa  231  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3650  dihydroorotase  35.33 
 
 
435 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311057  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1262  dihydroorotase  32.57 
 
 
440 aa  228  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.01 
 
 
439 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  31.28 
 
 
433 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.28 
 
 
433 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  30.95 
 
 
425 aa  225  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.75 
 
 
429 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  30.82 
 
 
442 aa  225  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1038  dihydroorotase  30.89 
 
 
440 aa  224  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.933737  hitchhiker  0.00310904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.04 
 
 
433 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  32.32 
 
 
433 aa  222  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.6 
 
 
433 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  31.57 
 
 
440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  34.66 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.81 
 
 
429 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  30.91 
 
 
436 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  30.95 
 
 
433 aa  219  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0898  dihydroorotase  30.68 
 
 
442 aa  219  7e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  31.6 
 
 
426 aa  219  7e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  31.87 
 
 
446 aa  219  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  33.49 
 
 
423 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  32.83 
 
 
428 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  32.83 
 
 
428 aa  218  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  32.83 
 
 
428 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1013  dihydroorotase  32.34 
 
 
449 aa  218  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0448021 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  32.83 
 
 
428 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  31.17 
 
 
430 aa  219  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  32.83 
 
 
428 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.54 
 
 
430 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  32.83 
 
 
428 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  32.83 
 
 
428 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  32.99 
 
 
428 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  33.74 
 
 
423 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.44 
 
 
434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  31.4 
 
 
427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  32.84 
 
 
428 aa  217  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  32.63 
 
 
430 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  32.59 
 
 
428 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.21 
 
 
434 aa  216  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  34.22 
 
 
458 aa  216  9e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  32.83 
 
 
432 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  30.24 
 
 
433 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.83 
 
 
430 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.63 
 
 
448 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  32.59 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  30.73 
 
 
426 aa  215  1.9999999999999998e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  32.32 
 
 
431 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  32.08 
 
 
432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.94 
 
 
433 aa  215  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1324  dihydroorotase  30.91 
 
 
454 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.198693 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  33.74 
 
 
423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  31.83 
 
 
448 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  31.43 
 
 
428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.87 
 
 
433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  30.33 
 
 
424 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.78 
 
 
428 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  32.04 
 
 
423 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  31.35 
 
 
428 aa  213  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.92 
 
 
433 aa  212  9e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.66 
 
 
437 aa  212  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  28.94 
 
 
436 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0755  dihydroorotase multifunctional complex type  32.78 
 
 
439 aa  212  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.916365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>