More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1038 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  68.41 
 
 
442 aa  637    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  68.64 
 
 
440 aa  658    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1038  dihydroorotase  100 
 
 
440 aa  910    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.933737  hitchhiker  0.00310904 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1262  dihydroorotase  68.88 
 
 
440 aa  638    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  67.97 
 
 
446 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0898  dihydroorotase  63.76 
 
 
442 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1013  dihydroorotase  63.99 
 
 
449 aa  580  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0448021 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.43 
 
 
435 aa  342  5e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.69 
 
 
425 aa  340  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.89 
 
 
430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.73 
 
 
434 aa  336  5.999999999999999e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.07 
 
 
430 aa  335  7e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.74 
 
 
436 aa  334  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.66 
 
 
429 aa  332  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.01 
 
 
429 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  41.51 
 
 
422 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.32 
 
 
424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.32 
 
 
425 aa  326  5e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.1 
 
 
424 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.44 
 
 
434 aa  324  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.1 
 
 
425 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.52 
 
 
425 aa  323  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.39 
 
 
432 aa  322  7e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  40.84 
 
 
427 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  40.42 
 
 
436 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.31 
 
 
430 aa  319  7.999999999999999e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  42.63 
 
 
426 aa  315  9e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.04 
 
 
430 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  41.42 
 
 
425 aa  315  9.999999999999999e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  43.12 
 
 
431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.14 
 
 
427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.29 
 
 
439 aa  313  4.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  38 
 
 
429 aa  312  9e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  37.85 
 
 
431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.68 
 
 
433 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  40.61 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  41.52 
 
 
425 aa  304  3.0000000000000004e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.58 
 
 
431 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  37.79 
 
 
459 aa  301  2e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  41.27 
 
 
425 aa  300  3e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  41.16 
 
 
426 aa  297  3e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.99 
 
 
434 aa  296  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.09 
 
 
448 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.23 
 
 
441 aa  296  5e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  36.96 
 
 
447 aa  296  6e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  40.26 
 
 
425 aa  294  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.45 
 
 
429 aa  294  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  39.09 
 
 
433 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.67 
 
 
447 aa  295  2e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.22 
 
 
433 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  39.03 
 
 
428 aa  291  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.64 
 
 
433 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.79 
 
 
442 aa  289  6e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  37.7 
 
 
429 aa  289  7e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.83 
 
 
428 aa  286  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.2 
 
 
425 aa  286  5e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  38.46 
 
 
426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.95 
 
 
438 aa  283  6.000000000000001e-75  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  36.61 
 
 
428 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  36.38 
 
 
428 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  36.38 
 
 
428 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  38.42 
 
 
425 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  39.23 
 
 
428 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  38.42 
 
 
425 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  36.38 
 
 
428 aa  280  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  36.38 
 
 
428 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  36.16 
 
 
428 aa  280  4e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  37.19 
 
 
427 aa  279  7e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  36.16 
 
 
428 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  36.16 
 
 
428 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  36.16 
 
 
428 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  35.62 
 
 
428 aa  277  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  40.05 
 
 
428 aa  276  4e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  36.18 
 
 
432 aa  276  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  35.7 
 
 
428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.44 
 
 
433 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4100  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.73 
 
 
473 aa  270  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.595035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6624  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.28 
 
 
434 aa  270  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.32 
 
 
425 aa  268  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3092  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.02 
 
 
437 aa  266  8e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  36.04 
 
 
423 aa  263  4e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1877  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.24 
 
 
439 aa  263  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.08 
 
 
433 aa  262  8e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  37.44 
 
 
431 aa  262  8e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  37.68 
 
 
431 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  37.68 
 
 
431 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  37.68 
 
 
431 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.7 
 
 
488 aa  259  7e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  37.19 
 
 
430 aa  259  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.85 
 
 
430 aa  259  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1870  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.15 
 
 
420 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  38.07 
 
 
425 aa  258  1e-67  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  36.87 
 
 
430 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  34.75 
 
 
427 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1793  dihydroorotase  33.33 
 
 
421 aa  257  3e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.823522  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  37.69 
 
 
448 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  34.25 
 
 
433 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.7 
 
 
434 aa  256  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.7 
 
 
434 aa  256  5e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  36.87 
 
 
462 aa  256  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>