More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6624 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6624  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 
434 aa  890    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4467  dihydroorotase, multifunctional complex type  60.84 
 
 
427 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.400386 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1793  dihydroorotase  47.45 
 
 
421 aa  417  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.823522  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3119  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.76 
 
 
419 aa  354  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317311  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3185  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.13 
 
 
419 aa  331  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.15 
 
 
434 aa  322  6e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08046  Dihydroorotase  40.51 
 
 
439 aa  322  7e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.156955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2449  amidohydrolase  41.84 
 
 
416 aa  312  7.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.62 
 
 
425 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.42 
 
 
427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  39.86 
 
 
422 aa  310  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0093  dihydroorotase  40.7 
 
 
418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  41.32 
 
 
427 aa  307  3e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.23 
 
 
425 aa  306  7e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.76 
 
 
424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.68 
 
 
424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.3 
 
 
425 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  40.64 
 
 
436 aa  302  8.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.18 
 
 
425 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.56 
 
 
436 aa  289  6e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  38.48 
 
 
426 aa  285  9e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.91 
 
 
428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.26 
 
 
441 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.41 
 
 
429 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  37.13 
 
 
425 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.32 
 
 
430 aa  277  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.14 
 
 
429 aa  276  4e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.47 
 
 
430 aa  276  4e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  39.95 
 
 
428 aa  276  7e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  36.7 
 
 
431 aa  274  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.79 
 
 
425 aa  273  4.0000000000000004e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1038  dihydroorotase  36.28 
 
 
440 aa  270  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.933737  hitchhiker  0.00310904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.7 
 
 
429 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.16 
 
 
433 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1317  dihydroorotase  35.83 
 
 
440 aa  266  7e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.898623  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  35.93 
 
 
431 aa  265  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.38 
 
 
430 aa  263  4.999999999999999e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  39.44 
 
 
432 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.17 
 
 
434 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  37.7 
 
 
433 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.21 
 
 
433 aa  260  3e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  37.27 
 
 
431 aa  260  4e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.02 
 
 
434 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  37.01 
 
 
423 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.47 
 
 
431 aa  258  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.01 
 
 
430 aa  257  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.01 
 
 
433 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  37.47 
 
 
428 aa  256  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.78 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.77 
 
 
435 aa  254  3e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  36.78 
 
 
423 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1262  dihydroorotase  34.09 
 
 
440 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0898  dihydroorotase  34.68 
 
 
442 aa  252  8.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.21 
 
 
439 aa  251  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.4 
 
 
432 aa  250  4e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  35.15 
 
 
446 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  36.16 
 
 
431 aa  247  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  35.55 
 
 
426 aa  246  4.9999999999999997e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  36 
 
 
430 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.04 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.16 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.57 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.24 
 
 
428 aa  243  5e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  34.77 
 
 
442 aa  243  6e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  35.17 
 
 
433 aa  243  6e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  34.25 
 
 
429 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.3 
 
 
433 aa  242  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  34.25 
 
 
425 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  34.71 
 
 
429 aa  240  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  35.39 
 
 
433 aa  239  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  34.02 
 
 
433 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.99 
 
 
429 aa  239  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  35.47 
 
 
431 aa  238  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.93 
 
 
433 aa  237  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1013  dihydroorotase  36.04 
 
 
449 aa  238  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0448021 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.11 
 
 
425 aa  237  3e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.93 
 
 
430 aa  237  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  34.71 
 
 
436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  34.4 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.42 
 
 
437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  34.4 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  34.4 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  34.4 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  34.71 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  34.94 
 
 
431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  34.4 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  34.4 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  33.26 
 
 
425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  35.8 
 
 
430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1091  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.84 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000303953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  34.4 
 
 
425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.84 
 
 
446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.16 
 
 
434 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  32.64 
 
 
423 aa  233  5e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  34.95 
 
 
432 aa  233  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  32.72 
 
 
426 aa  233  6e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.71 
 
 
448 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  36.36 
 
 
428 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  34.71 
 
 
436 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.67 
 
 
434 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>