More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2449 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2449  amidohydrolase  100 
 
 		 416 aa  836    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08046  Dihydroorotase  59.42 
 
 		 439 aa  496  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.156955  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0093  dihydroorotase  53.86 
 
 		 418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3119  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.34 
 
 		 419 aa  350  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317311  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6624  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.94 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3185  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.2 
 
 		 419 aa  319  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1793  dihydroorotase  41.11 
 
 		 421 aa  319  5e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.823522  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4467  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.33 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.400386 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1682  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.05 
 
 		 427 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00070754  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.15 
 
 		 436 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.48 
 
 		 434 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.24 
 
 		 429 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.2 
 
 		 428 aa  298  9e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.19 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.02 
 
 		 429 aa  289  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  39.18 
 
 		 427 aa  289  7e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  39.42 
 
 		 436 aa  289  7e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  38.35 
 
 		 431 aa  288  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.44 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.24 
 
 		 424 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  38.06 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.2 
 
 		 425 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.44 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.86 
 
 		 425 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.71 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  37.23 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.25 
 
 		 425 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  36.74 
 
 		 422 aa  276  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.83 
 
 		 430 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  38.01 
 
 		 436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  37.29 
 
 		 433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.79 
 
 		 441 aa  270  4e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.96 
 
 		 430 aa  270  4e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.98 
 
 		 430 aa  270  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.34 
 
 		 434 aa  269  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  36.56 
 
 		 433 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  36.93 
 
 		 431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  36.56 
 
 		 436 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  36.56 
 
 		 433 aa  265  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  38.7 
 
 		 431 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  36.56 
 
 		 433 aa  263  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0813  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.29 
 
 		 435 aa  264  3e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0402861  normal  0.237167 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.2 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  38.11 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3014  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.63 
 
 		 429 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0145836  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  36.71 
 
 		 428 aa  259  7e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  37.77 
 
 		 437 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.47 
 
 		 437 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  37.53 
 
 		 428 aa  257  3e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  37.53 
 
 		 428 aa  256  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  37.02 
 
 		 428 aa  256  8e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3004  dihydroorotase  35.45 
 
 		 430 aa  255  9e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.32072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3104  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.98 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0529728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.5 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2091  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.47 
 
 		 439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.129305 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.83 
 
 		 431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  36.69 
 
 		 428 aa  254  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1854  dihydroorotase  37.25 
 
 		 425 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513427 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.84 
 
 		 429 aa  253  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1372  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.95 
 
 		 448 aa  253  6e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3151  dihydroorotase multifunctional complex type  38.13 
 
 		 432 aa  252  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059422 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.61 
 
 		 434 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2265  dihydroorotase  38.5 
 
 		 462 aa  252  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.360956  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.23 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.45 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.61 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  35.18 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2806  dihydroorotase  36.82 
 
 		 431 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1300  dihydroorotase  39.44 
 
 		 428 aa  250  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115312  normal  0.0109534 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17970  dihydroorotase  36.49 
 
 		 448 aa  250  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2002  dihydroorotase  36.8 
 
 		 449 aa  249  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1353  dihydroorotase  38.15 
 
 		 433 aa  249  6e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0276839 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  35.22 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.5 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1847  dihydroorotase  36.36 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.140759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.95 
 
 		 430 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.53 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.99 
 
 		 433 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.75 
 
 		 432 aa  246  4e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  36.32 
 
 		 446 aa  246  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3201  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.34 
 
 		 447 aa  246  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.13 
 
 		 434 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.38 
 
 		 433 aa  245  9e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2429  dihydroorotase  36.9 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  33.41 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3135  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.65 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1324  dihydroorotase  34.89 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.198693 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  34.31 
 
 		 427 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2035  dihydroorotase  35.21 
 
 		 432 aa  243  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0194296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3201  dihydroorotase  34.75 
 
 		 458 aa  243  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0334723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1336  dihydroorotase  34.1 
 
 		 446 aa  242  7.999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4278  dihydroorotase  36.32 
 
 		 435 aa  242  9e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  33.41 
 
 		 429 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  35.35 
 
 		 431 aa  242  1e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.59 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1209  dihydroorotase  36.24 
 
 		 425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.242155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  34.82 
 
 		 429 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.71 
 
 		 425 aa  239  5e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  35.51 
 
 		 430 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1356  dihydroorotase  33.11 
 
 		 442 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>