More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3528 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  82.22 
 
 		 433 aa  730    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  83.33 
 
 		 433 aa  717    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  89.91 
 
 		 436 aa  783    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  84.99 
 
 		 437 aa  727    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  90.3 
 
 		 433 aa  782    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  82.91 
 
 		 433 aa  716    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  100 
 
 		 436 aa  868    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  67.67 
 
 		 438 aa  581  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  64.07 
 
 		 434 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  63.12 
 
 		 433 aa  526  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  63.36 
 
 		 434 aa  526  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  64 
 
 		 433 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  63.01 
 
 		 430 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  63.03 
 
 		 434 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  59.81 
 
 		 446 aa  487  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  58.16 
 
 		 428 aa  483  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  60.05 
 
 		 439 aa  484  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  58.67 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  57.92 
 
 		 428 aa  479  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  57.55 
 
 		 429 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  58.87 
 
 		 428 aa  481  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  58.33 
 
 		 434 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  55.06 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  55.21 
 
 		 428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  52.82 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  53.76 
 
 		 430 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  50.6 
 
 		 432 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.12 
 
 		 425 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  50.12 
 
 		 425 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.41 
 
 		 424 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.53 
 
 		 434 aa  395  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  50.59 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.88 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  49.65 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  50.82 
 
 		 432 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  45.99 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.54 
 
 		 430 aa  359  5e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.98 
 
 		 425 aa  346  6e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.75 
 
 		 424 aa  345  1e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.52 
 
 		 447 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.04 
 
 		 425 aa  342  7e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  39.67 
 
 		 447 aa  341  1e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.69 
 
 		 434 aa  339  7e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.79 
 
 		 424 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  40.57 
 
 		 422 aa  335  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  39.76 
 
 		 459 aa  333  3e-90  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  42.08 
 
 		 425 aa  332  6e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.5 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.66 
 
 		 425 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.6 
 
 		 434 aa  323  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.95 
 
 		 441 aa  322  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  40.14 
 
 		 436 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.83 
 
 		 425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  38.06 
 
 		 426 aa  312  9e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.09 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.66 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.71 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  41.78 
 
 		 431 aa  310  4e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  39.91 
 
 		 427 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.22 
 
 		 433 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0613  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.3 
 
 		 428 aa  306  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.958192  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  39.29 
 
 		 425 aa  306  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.56 
 
 		 438 aa  305  9.000000000000001e-82  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  39.91 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  39.91 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  38.59 
 
 		 425 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.18 
 
 		 428 aa  303  6.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3948  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.34 
 
 		 442 aa  302  7.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121756  normal  0.0185231 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  38.35 
 
 		 425 aa  299  8e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  39.18 
 
 		 431 aa  299  8e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  39.02 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.24 
 
 		 436 aa  295  9e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.78 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  37.62 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1574  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.32 
 
 		 431 aa  293  6e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.55 
 
 		 433 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.68 
 
 		 425 aa  292  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  40.14 
 
 		 424 aa  292  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  41.08 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  35.6 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.91 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  38.71 
 
 		 431 aa  287  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  38.71 
 
 		 431 aa  287  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  38.82 
 
 		 425 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  38.82 
 
 		 425 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  38.82 
 
 		 425 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  38.82 
 
 		 425 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  38.82 
 
 		 425 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  38.82 
 
 		 425 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  39.06 
 
 		 429 aa  286  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  39.86 
 
 		 425 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  39.44 
 
 		 439 aa  286  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  38.82 
 
 		 425 aa  286  7e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1673  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.44 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.557372  normal  0.0225661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  40.8 
 
 		 448 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  38.59 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  39.53 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  37 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  38.12 
 
 		 423 aa  283  4.0000000000000003e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  37.32 
 
 		 424 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>