More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3072 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3072  dihydroorotase  100 
 
 		 436 aa  881    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.490545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  72.52 
 
 		 425 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0933537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1003  dihydroorotase  72.22 
 
 		 425 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15328  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0222  dihydroorotase, multifunctional complex type  71.76 
 
 		 424 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2554  dihydroorotase, multifunctional complex type  67.89 
 
 		 423 aa  568  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3905  dihydroorotase  69.23 
 
 		 422 aa  566  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.606777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3094  dihydroorotase  69.21 
 
 		 432 aa  560  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0245996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  52.08 
 
 		 434 aa  422  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.8 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.46 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  50.35 
 
 		 433 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  49.65 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  50 
 
 		 434 aa  391  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  49.65 
 
 		 436 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.53 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  48.72 
 
 		 433 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  48.02 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  48.95 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  49.54 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  50.93 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  49.88 
 
 		 437 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  49.18 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  47.32 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.6 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  46.15 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  45.92 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1358  dihydroorotase  47.67 
 
 		 428 aa  364  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585167  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3849  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.8 
 
 		 439 aa  360  4e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.058395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  44.84 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3419  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.79 
 
 		 446 aa  353  4e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.274292  normal  0.515127 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0840  dihydroorotase  42.33 
 
 		 431 aa  352  8.999999999999999e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0948498  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  45.97 
 
 		 434 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  43.69 
 
 		 432 aa  349  6e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1761  dihydroorotase  47.67 
 
 		 430 aa  346  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0935  dihydroorotase  46.14 
 
 		 430 aa  333  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.513523 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.16 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  36.49 
 
 		 447 aa  300  4e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0154  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.25 
 
 		 438 aa  299  8e-80  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.55 
 
 		 430 aa  293  6e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0373  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.79 
 
 		 447 aa  291  1e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0824446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  37.24 
 
 		 425 aa  290  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0230  dihydroorotase  36.49 
 
 		 459 aa  285  9e-76  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  36.84 
 
 		 427 aa  283  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  38.84 
 
 		 425 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  36.16 
 
 		 436 aa  275  8e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  36.95 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  37.32 
 
 		 425 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0732  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.7 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  37.09 
 
 		 425 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.71 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.44 
 
 		 429 aa  266  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  35.42 
 
 		 422 aa  266  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  36.16 
 
 		 428 aa  265  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0923  amidohydrolase  40.09 
 
 		 407 aa  262  8e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.671663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  37.62 
 
 		 423 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  38.02 
 
 		 423 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.78 
 
 		 424 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2269  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.32 
 
 		 425 aa  260  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0467861  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  35.09 
 
 		 431 aa  259  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  36.83 
 
 		 423 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  37.3 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  36.64 
 
 		 424 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.4 
 
 		 441 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.58 
 
 		 429 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  37.3 
 
 		 423 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.1 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.49 
 
 		 434 aa  256  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0371  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.58 
 
 		 436 aa  256  5e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.623937  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0603  dihydroorotase  39.06 
 
 		 409 aa  256  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.311442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  37.06 
 
 		 423 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  34.65 
 
 		 431 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.41 
 
 		 433 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  37.56 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  37.56 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  37.56 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  37.56 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  37.56 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  37.56 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  37.56 
 
 		 425 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1320  dihydroorotase  33.02 
 
 		 423 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.17 
 
 		 425 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  36.26 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  36.18 
 
 		 439 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  33.56 
 
 		 426 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.41 
 
 		 425 aa  252  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  37.1 
 
 		 423 aa  253  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.17 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  33.72 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  35.53 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  37.09 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4018  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.42 
 
 		 434 aa  250  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  34.97 
 
 		 431 aa  250  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  37.06 
 
 		 423 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  35.01 
 
 		 428 aa  250  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.18 
 
 		 424 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1714  dihydroorotase  35.92 
 
 		 425 aa  249  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.644473  normal  0.407815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.79 
 
 		 429 aa  249  7e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  36.53 
 
 		 428 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  37.47 
 
 		 448 aa  249  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3062  dihydroorotase  35.98 
 
 		 409 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>