More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0839 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  85.41 
 
 
425 aa  736    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  80.19 
 
 
425 aa  702    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  85.41 
 
 
425 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  85.41 
 
 
425 aa  736    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  85.41 
 
 
425 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3966  dihydroorotase  95.52 
 
 
425 aa  798    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2520  dihydroorotase  92.76 
 
 
428 aa  796    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  85.41 
 
 
425 aa  740    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0758  dihydroorotase  95.53 
 
 
425 aa  820    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.442248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3807  dihydroorotase  81.41 
 
 
426 aa  712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0386  dihydroorotase  98.82 
 
 
425 aa  840    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  85.41 
 
 
425 aa  736    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0874  dihydroorotase  80.85 
 
 
425 aa  703    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.762584 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  85.41 
 
 
425 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0741  dihydroorotase  94.86 
 
 
428 aa  814    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  85.41 
 
 
425 aa  736    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0868  dihydroorotase  98.82 
 
 
425 aa  840    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0839  dihydroorotase  100 
 
 
425 aa  848    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.812582  hitchhiker  0.00138638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0571  dihydroorotase  71.53 
 
 
425 aa  624  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0623  dihydroorotase  71.29 
 
 
425 aa  624  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0679  dihydroorotase  72 
 
 
425 aa  623  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  69.34 
 
 
439 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0709  dihydroorotase  71.56 
 
 
448 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.695042  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1582  amidohydrolase  66.9 
 
 
431 aa  575  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1146  dihydroorotase  66.05 
 
 
446 aa  569  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0911  dihydroorotase  66.82 
 
 
431 aa  558  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.480107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2892  amidohydrolase  65.66 
 
 
431 aa  557  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3569  dihydroorotase  65.66 
 
 
431 aa  557  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.680338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3344  allantoinase  64.97 
 
 
431 aa  551  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.284752  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1381  amidohydrolase  63.81 
 
 
435 aa  550  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.849591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4613  dihydroorotase  65.41 
 
 
427 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.510066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0709  dihydroorotase  64.75 
 
 
439 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2583  dihydroorotase  60.52 
 
 
424 aa  514  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3699  dihydroorotase  61.08 
 
 
425 aa  508  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1513  allantoinase  63.05 
 
 
432 aa  506  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.271426  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3958  putative dihydroorotase-like protein  62.9 
 
 
441 aa  503  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167929 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2482  dihydroorotase  59 
 
 
424 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  58.77 
 
 
424 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3889  dihydroorotase  54.85 
 
 
415 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.238894  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2914  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.28 
 
 
426 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135496  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0364  dihydroorotase multifunctional complex type  46.21 
 
 
429 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0345  dihydroorotase  47.03 
 
 
426 aa  365  1e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2332  dihydroorotase family protein  46.32 
 
 
431 aa  364  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0942  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.1 
 
 
427 aa  362  6e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5041  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.05 
 
 
423 aa  358  9e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5315  dihydroorotase  46.34 
 
 
423 aa  358  9e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.230252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0481  dihydroorotase  45.28 
 
 
423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.25 
 
 
428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1352  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.46 
 
 
458 aa  354  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03110  dihydroorotase  47.52 
 
 
423 aa  353  4e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0862849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05250  dihydroorotase  45.15 
 
 
423 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2410  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.26 
 
 
431 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.497923  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4873  dihydroorotase  45.63 
 
 
423 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.423102  normal  0.0991543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4999  dihydroorotase  45.39 
 
 
423 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0501  dihydroorotase  44.92 
 
 
423 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0543  dihydroorotase  41.61 
 
 
425 aa  336  5e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5049  dihydroorotase  45.86 
 
 
423 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0396  dihydroorotase  43.26 
 
 
423 aa  335  7e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0465  dihydroorotase  45.86 
 
 
423 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3513  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.02 
 
 
433 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3636  dihydroorotase, multifunctional complex type  46 
 
 
434 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.33 
 
 
425 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3313  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.52 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.582859 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1897  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.62 
 
 
424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3918  dihydroorotase  44.12 
 
 
438 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3311  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.57 
 
 
433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1770  dihydroorotase  38.57 
 
 
422 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0135221  normal  0.0984077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4347  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.52 
 
 
430 aa  298  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.909107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2084  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.91 
 
 
425 aa  296  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.178294  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0472  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.78 
 
 
434 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.12917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2008  dihydroorotase  41.41 
 
 
433 aa  294  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3191  dihydroorotase  41.35 
 
 
432 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4726  dihydroorotase  39.62 
 
 
433 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2835  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.91 
 
 
433 aa  286  4e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.64 
 
 
425 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0102  dihydroorotase  38.92 
 
 
428 aa  286  7e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2283  dihydroorotase  40.65 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.370028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.17 
 
 
425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1304  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.62 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00973058  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  37.32 
 
 
427 aa  284  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  37.56 
 
 
436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3528  dihydroorotase  39.86 
 
 
436 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468445  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.47 
 
 
424 aa  282  8.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.2 
 
 
429 aa  282  9e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1642  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.2 
 
 
430 aa  281  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.28173 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3667  dihydroorotase  41.31 
 
 
428 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0554929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3760  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.5 
 
 
437 aa  280  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  37.2 
 
 
425 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.23 
 
 
429 aa  280  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0565  dihydroorotase  40.43 
 
 
428 aa  280  4e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0600  dihydroorotase  40.38 
 
 
428 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1516  dihydroorotase, multifunctional complex type  41.06 
 
 
434 aa  277  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3029  dihydroorotase  39.15 
 
 
433 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2423  dihydroorotase  39.62 
 
 
436 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2040  chaperone protein HtpG (heat shock protein htpG; high temperatureprotein G)  36.15 
 
 
425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.245772  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  37.23 
 
 
431 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1390  dihydroorotase  38.48 
 
 
429 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.0725685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2246  dihydroorotase  40.57 
 
 
437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.607356  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1298  dihydroorotase  39.24 
 
 
434 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0828078  hitchhiker  0.00606747 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1855  dihydroorotase-like protein  40.61 
 
 
383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000930966  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>