More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3038 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  98.9 
 
 		 456 aa  897    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  88.84 
 
 		 458 aa  775    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  76.13 
 
 		 465 aa  688    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  100 
 
 		 456 aa  910    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  100 
 
 		 456 aa  910    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  61.84 
 
 		 453 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  59.5 
 
 		 444 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  60.41 
 
 		 446 aa  522  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  57.44 
 
 		 442 aa  521  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  59.5 
 
 		 444 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  58.81 
 
 		 444 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  59.95 
 
 		 444 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  57.89 
 
 		 464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  58.26 
 
 		 440 aa  509  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  58.39 
 
 		 445 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  58.62 
 
 		 446 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  59.08 
 
 		 446 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  59.04 
 
 		 444 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  58.16 
 
 		 445 aa  498  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  57.01 
 
 		 442 aa  500  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  57.7 
 
 		 446 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  54.69 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  54.23 
 
 		 444 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  54.23 
 
 		 445 aa  483  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  54.46 
 
 		 444 aa  478  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  54.46 
 
 		 444 aa  478  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  55.84 
 
 		 444 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  52.63 
 
 		 441 aa  476  1e-133  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  55.63 
 
 		 441 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  51.03 
 
 		 439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  53.55 
 
 		 439 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  51.6 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  44.5 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  44.5 
 
 		 437 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.21 
 
 		 442 aa  358  8e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  43.02 
 
 		 439 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4426  dihydroorotase  42.24 
 
 		 440 aa  347  2e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0411696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  43.02 
 
 		 439 aa  346  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2177  dihydroorotase  42.82 
 
 		 443 aa  346  5e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1891 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  44.22 
 
 		 442 aa  341  2e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  43.05 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  43.05 
 
 		 443 aa  333  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1662  dihydroorotase  40.86 
 
 		 469 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.953496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  39.56 
 
 		 446 aa  295  9e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  37.02 
 
 		 445 aa  290  4e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  36.94 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  39.07 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  37.62 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0305  dihydroorotase  38.98 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3692  dihydroorotase  36.22 
 
 		 453 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  34.38 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5385  amidohydrolase  37.61 
 
 		 445 aa  283  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  38.75 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00361  dihydroorotase  38.94 
 
 		 449 aa  280  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0674237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  37.97 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  35.48 
 
 		 444 aa  272  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  36.95 
 
 		 444 aa  265  1e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  34.54 
 
 		 444 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  35.97 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  37.79 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  39.34 
 
 		 432 aa  252  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  40.14 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_002950  PG0919  dihydroorotase  36.86 
 
 		 449 aa  248  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.533166 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  34.72 
 
 		 455 aa  243  7e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  38.68 
 
 		 445 aa  242  9e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  37.65 
 
 		 445 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  36.98 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.21 
 
 		 457 aa  233  8.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.91 
 
 		 494 aa  232  9e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.05 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  37.19 
 
 		 449 aa  227  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2602  amidohydrolase  31.25 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  35.28 
 
 		 461 aa  221  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  33.26 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  33.26 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  33.26 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  33.26 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0970  dihydroorotase  36.56 
 
 		 488 aa  216  5e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.277492  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.6 
 
 		 418 aa  216  9e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  36.28 
 
 		 448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0212  dihydroorotase  38.32 
 
 		 423 aa  213  7.999999999999999e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  32.57 
 
 		 453 aa  212  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  32.57 
 
 		 453 aa  212  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  32.57 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  32.57 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  31.44 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  32.36 
 
 		 449 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  31.88 
 
 		 453 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.97 
 
 		 418 aa  211  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  32.11 
 
 		 453 aa  209  9e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  31.65 
 
 		 453 aa  209  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.5 
 
 		 454 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.5 
 
 		 420 aa  206  9e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1111  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.69 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1448  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.42 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  31.78 
 
 		 426 aa  201  3e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  34.64 
 
 		 489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  35.87 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.19 
 
 		 425 aa  196  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  31.54 
 
 		 462 aa  196  7e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>