More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5682 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  100 
 
 		 444 aa  885    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  33.71 
 
 		 444 aa  239  8e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  33.71 
 
 		 444 aa  239  8e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  35.03 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  32.81 
 
 		 444 aa  233  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  34.65 
 
 		 444 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  34.97 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  34.37 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  31.83 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  34 
 
 		 446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  33.85 
 
 		 444 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  34.15 
 
 		 445 aa  219  8.999999999999998e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  33.78 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  32.88 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  34.34 
 
 		 446 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  33.19 
 
 		 440 aa  216  9e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  32.96 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.88 
 
 		 457 aa  211  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  32.89 
 
 		 464 aa  208  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  34.21 
 
 		 444 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  33.63 
 
 		 446 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  33.85 
 
 		 461 aa  205  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.82 
 
 		 494 aa  203  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  33.12 
 
 		 445 aa  203  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  32.3 
 
 		 449 aa  202  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  33.26 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  30.8 
 
 		 462 aa  199  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  32.15 
 
 		 444 aa  199  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  34.51 
 
 		 453 aa  195  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  35.43 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  35.43 
 
 		 456 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  32.82 
 
 		 477 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  31.58 
 
 		 453 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  31.58 
 
 		 453 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  31.58 
 
 		 453 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  31.58 
 
 		 453 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  32.96 
 
 		 445 aa  192  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  31.43 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  30.77 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  30.18 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  30.71 
 
 		 468 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2099  phenylhydantoinase  34.83 
 
 		 463 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0317322  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  30.99 
 
 		 453 aa  189  7e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  35.57 
 
 		 458 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  31.21 
 
 		 453 aa  189  9e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  31.21 
 
 		 453 aa  189  9e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  33.56 
 
 		 465 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  32.79 
 
 		 432 aa  189  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  31.93 
 
 		 448 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  31.21 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  31.21 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  30.77 
 
 		 453 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1159  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.49 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.120119  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0757  dihydroorotase  31.38 
 
 		 455 aa  187  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.405973  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  35.19 
 
 		 456 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1730  dihydropyrimidinase  30.04 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  32.52 
 
 		 469 aa  183  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  34.13 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  34.13 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  29.33 
 
 		 449 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  30.18 
 
 		 457 aa  180  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  31.93 
 
 		 449 aa  180  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.36 
 
 		 444 aa  179  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  31.54 
 
 		 455 aa  179  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  32.59 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.89 
 
 		 442 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  27.65 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.93 
 
 		 454 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1843  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 		 437 aa  177  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.917373  normal  0.399349 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1684  dihydropyrimidinase  29.41 
 
 		 464 aa  177  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  31.84 
 
 		 466 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  29.83 
 
 		 473 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  30.47 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0965  dihydroorotase (DHOase)  30.8 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  30.47 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  32.74 
 
 		 439 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0326  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.26 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.622278  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5637  dihydropyrimidinase  29.72 
 
 		 495 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  34.57 
 
 		 449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  29.27 
 
 		 458 aa  173  5e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  29.16 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1709  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.62 
 
 		 433 aa  172  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  32.76 
 
 		 480 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.6 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  34.56 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24200  dihydropyrimidinase  29.68 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  29.59 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  27.72 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  33.41 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3033  phenylhydantoinase  31.26 
 
 		 461 aa  170  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  33.56 
 
 		 442 aa  170  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  28.51 
 
 		 445 aa  169  6e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0553  dihydroorotase  27.33 
 
 		 446 aa  169  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  33.73 
 
 		 440 aa  169  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0835  phenylhydantoinase  31.26 
 
 		 461 aa  169  9e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02706  dihydropyrimidinase  31.26 
 
 		 461 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02668  hypothetical protein  31.26 
 
 		 461 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3198  phenylhydantoinase  31.26 
 
 		 461 aa  169  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3006  phenylhydantoinase  31.26 
 
 		 465 aa  169  9e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4163  phenylhydantoinase  31.26 
 
 		 465 aa  169  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>