More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1177 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  100 
 
 		 449 aa  934    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  48.99 
 
 		 449 aa  426  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  47.56 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  49.19 
 
 		 448 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  47.42 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  42.7 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  42.7 
 
 		 453 aa  372  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  42.92 
 
 		 453 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  42.7 
 
 		 453 aa  372  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  42.92 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  42.7 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  42.7 
 
 		 453 aa  368  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  42.57 
 
 		 453 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  42.57 
 
 		 453 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  42.57 
 
 		 453 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  42.57 
 
 		 453 aa  363  3e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  38.43 
 
 		 448 aa  329  7e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  39.04 
 
 		 458 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  37.82 
 
 		 443 aa  282  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  36.43 
 
 		 435 aa  274  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  35.25 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  37.32 
 
 		 473 aa  270  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  36.06 
 
 		 476 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  34.88 
 
 		 450 aa  267  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  37.16 
 
 		 449 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  35.71 
 
 		 447 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  35.18 
 
 		 449 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  33.63 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  33.92 
 
 		 503 aa  264  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  36.94 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  35.49 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  34.51 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.37 
 
 		 457 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.73 
 
 		 494 aa  243  6e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  37.39 
 
 		 473 aa  239  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  33.33 
 
 		 468 aa  239  9e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  36.74 
 
 		 453 aa  236  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  33.4 
 
 		 480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  33.48 
 
 		 506 aa  234  3e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  37.43 
 
 		 569 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  35.09 
 
 		 442 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  31.98 
 
 		 456 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  31.98 
 
 		 456 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  32.14 
 
 		 465 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  30.55 
 
 		 477 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  32.43 
 
 		 458 aa  202  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  31.32 
 
 		 446 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  31.76 
 
 		 456 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  32.1 
 
 		 466 aa  200  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  30.23 
 
 		 484 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  31.49 
 
 		 440 aa  199  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  32.54 
 
 		 481 aa  199  9e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  29.24 
 
 		 445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2936  dihydroorotase  31.71 
 
 		 453 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  32.52 
 
 		 441 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  31.17 
 
 		 442 aa  196  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  31.01 
 
 		 442 aa  195  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  29.21 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  29.95 
 
 		 444 aa  193  5e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  31.56 
 
 		 448 aa  192  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  29.73 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  30.25 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1007  dihydroorotase  28.8 
 
 		 443 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.240193  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  32.57 
 
 		 454 aa  190  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  28.63 
 
 		 462 aa  189  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  28.96 
 
 		 444 aa  189  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  29.39 
 
 		 484 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  31.86 
 
 		 464 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  29.35 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0292  dihydroorotase, multifunctional complex type  30 
 
 		 442 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  30.07 
 
 		 467 aa  188  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  30.02 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  31.86 
 
 		 459 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  30.6 
 
 		 445 aa  187  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  30.75 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  29.6 
 
 		 446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3102  dihydroorotase  30.4 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.544962 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01635  dihydroorotase  29.52 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  29.75 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  29.62 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  30.33 
 
 		 458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  30.31 
 
 		 444 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  28.92 
 
 		 444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.72 
 
 		 429 aa  183  6e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1798  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.16 
 
 		 444 aa  183  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4357  dihydroorotase  32 
 
 		 444 aa  183  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  29.37 
 
 		 446 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  29.6 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  29.6 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3229  dihydroorotase  29.98 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.174621 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  29.33 
 
 		 444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  30.91 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7096  dihydroorotase  27.47 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000589458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  30.02 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1889  dihydroorotase  28.38 
 
 		 444 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0259  dihydroorotase  28.28 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.212286  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  30.46 
 
 		 437 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  30.46 
 
 		 437 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  27.96 
 
 		 453 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5803  dihydroorotase  30.56 
 
 		 439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.356381  normal  0.871974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>