More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0839 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  100 
 
 		 453 aa  882    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  77.19 
 
 		 480 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  55.41 
 
 		 449 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  56.72 
 
 		 476 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  54.57 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  57.76 
 
 		 435 aa  451  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  59 
 
 		 443 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  58.49 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  54.4 
 
 		 450 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  49.89 
 
 		 455 aa  430  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  50.57 
 
 		 447 aa  418  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  48.42 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  48.9 
 
 		 447 aa  415  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  51.48 
 
 		 503 aa  402  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  51.39 
 
 		 468 aa  404  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  46.71 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  51.53 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  58.67 
 
 		 569 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  44.06 
 
 		 473 aa  368  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  53.78 
 
 		 473 aa  363  3e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  41.9 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  39.86 
 
 		 449 aa  289  5.0000000000000004e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  36.89 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  36.89 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  36.89 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  36.89 
 
 		 453 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  39.82 
 
 		 448 aa  279  9e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  35.96 
 
 		 453 aa  278  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  35.73 
 
 		 453 aa  276  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  36.19 
 
 		 453 aa  276  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  39.1 
 
 		 461 aa  275  9e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  35.96 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  35.96 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  35.96 
 
 		 453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  35.5 
 
 		 453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  42.2 
 
 		 481 aa  271  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  36.74 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  39.16 
 
 		 454 aa  263  6e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  35.17 
 
 		 458 aa  253  7e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  31.7 
 
 		 452 aa  225  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  38.46 
 
 		 474 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  38.2 
 
 		 570 aa  198  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.8 
 
 		 457 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.57 
 
 		 494 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  33.33 
 
 		 444 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  32.37 
 
 		 440 aa  180  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  40.43 
 
 		 579 aa  180  4e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  34.57 
 
 		 446 aa  179  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  31.74 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  31.95 
 
 		 444 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  33.25 
 
 		 442 aa  172  9e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  31.37 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  31.37 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  31.09 
 
 		 470 aa  171  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  33.1 
 
 		 445 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0624  amidohydrolase  35.89 
 
 		 394 aa  169  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  33.41 
 
 		 446 aa  169  8e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  32.1 
 
 		 446 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1463  dihydroorotase  33.01 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1180  dihydroorotase  33.01 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.887976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  31.99 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  31.99 
 
 		 475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  31.99 
 
 		 475 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  32.87 
 
 		 445 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0488  dihydroorotase  33.41 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.04796 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  32.23 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  29.39 
 
 		 468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  30.93 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  31.48 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  33.49 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  31.49 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  33.26 
 
 		 467 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  31.94 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  28.57 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  32.88 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  32.99 
 
 		 446 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  31.8 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  32.85 
 
 		 458 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1118  dihydroorotase  32.74 
 
 		 444 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  28.88 
 
 		 459 aa  160  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  35.96 
 
 		 454 aa  160  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  32.32 
 
 		 454 aa  159  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  31.33 
 
 		 477 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  31.48 
 
 		 444 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  30.63 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  33.33 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  33.33 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  30.47 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  31.11 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0266  dihydroorotase  32.95 
 
 		 442 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  30.84 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  31.85 
 
 		 465 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4149  dihydroorotase  30.66 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.171454 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  28 
 
 		 431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  33.1 
 
 		 456 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0124  dihydroorotase  27.08 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00282243  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  29.62 
 
 		 474 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  27.09 
 
 		 447 aa  154  4e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  29.85 
 
 		 426 aa  154  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  33.57 
 
 		 466 aa  153  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>