More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2590 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  100 
 
 		 476 aa  936    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  71.72 
 
 		 446 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  70.6 
 
 		 450 aa  606  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  63.05 
 
 		 455 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  64.19 
 
 		 447 aa  571  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  61.12 
 
 		 449 aa  567  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  63.55 
 
 		 447 aa  560  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  65.83 
 
 		 443 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  61.38 
 
 		 449 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  62.53 
 
 		 457 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  59.91 
 
 		 503 aa  496  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  60.5 
 
 		 435 aa  495  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  61.5 
 
 		 473 aa  465  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  58.03 
 
 		 442 aa  457  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  63.34 
 
 		 569 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  55.91 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  56.72 
 
 		 453 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  52.16 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  47.32 
 
 		 448 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  46.36 
 
 		 473 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  43.91 
 
 		 506 aa  355  8.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  42.46 
 
 		 448 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  41.43 
 
 		 449 aa  307  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  39.12 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  39.12 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  38.89 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  39.12 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  39.49 
 
 		 453 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  39.49 
 
 		 453 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  39.49 
 
 		 453 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  39.49 
 
 		 453 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  39.12 
 
 		 453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  38.89 
 
 		 453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  45.11 
 
 		 481 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  38.89 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  41.15 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.11 
 
 		 454 aa  300  4e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  35.79 
 
 		 458 aa  279  8e-74  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  36.06 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  36.18 
 
 		 452 aa  266  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0962  dihydroorotase  38.72 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.414994  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.47 
 
 		 494 aa  225  1e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35101  predicted protein  40.11 
 
 		 570 aa  219  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.24 
 
 		 457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34891  Allantoinase  41.64 
 
 		 579 aa  206  7e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.93559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0624  amidohydrolase  37.68 
 
 		 394 aa  200  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  34.05 
 
 		 432 aa  197  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  32.19 
 
 		 440 aa  186  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  34.4 
 
 		 446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  33.18 
 
 		 444 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1415  dihydroorotase  34.03 
 
 		 446 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1817  dihydroorotase  31.12 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0249027  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  32.72 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0692  dihydroorotase  34.75 
 
 		 446 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  32.57 
 
 		 444 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  32.37 
 
 		 456 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  32.37 
 
 		 456 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5682  amidohydrolase  34.56 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.74183  normal  0.205255 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0639  dihydroorotase  28.98 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  31.78 
 
 		 445 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  33.49 
 
 		 454 aa  173  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  33.48 
 
 		 465 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  34.55 
 
 		 441 aa  173  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4672  dihydroorotase  32.64 
 
 		 445 aa  172  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.214309  normal  0.620217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  31.65 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2736  dihydroorotase  32.38 
 
 		 448 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.157935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  31.64 
 
 		 444 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  31.92 
 
 		 456 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  36.49 
 
 		 454 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  31.58 
 
 		 442 aa  170  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  29.28 
 
 		 444 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3445  dihydropyrimidinase  30.66 
 
 		 460 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00364742  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  30.07 
 
 		 468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  30.46 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4820  dihydroorotase  32.07 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  29.15 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0668  dihydroorotase  29.7 
 
 		 444 aa  167  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  31.87 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0274  dihydroorotase  30.16 
 
 		 449 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1767  dihydroorotase  30.16 
 
 		 453 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  32.8 
 
 		 458 aa  167  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0661  dihydroorotase  29.7 
 
 		 444 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388126  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  30.93 
 
 		 428 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  30.93 
 
 		 428 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  30.93 
 
 		 428 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  32.3 
 
 		 458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2311  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.03 
 
 		 425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4018  dihydroorotase  32.42 
 
 		 464 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2511  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.93 
 
 		 429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0158286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  30.32 
 
 		 427 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  30.38 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1915  dihydroorotase  31.43 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.55 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  30.41 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3269  amidohydrolase  29.87 
 
 		 470 aa  164  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  30.67 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0124  dihydroorotase  29.08 
 
 		 430 aa  164  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00282243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.57 
 
 		 425 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  30.67 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4303  dihydroorotase  32.41 
 
 		 445 aa  163  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.661372  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>